RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 HECW1Q76N89 1606 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 EFCAB5A4FU69 1503 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 CPS1P31327 1500 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 A0A0G2JMP0 313 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 A0A0X1KG70 313 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 KRBOX1C9JBD0 128 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 H0YJX3 145 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 TGOLN2O43493 480 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 ISG15P05161 165 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 CD99P14209 185 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 PRTN3P24158 256 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 PPP1CAP62136 330 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 GRB2P62993 217 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
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CCL20-204ENST00000489160 CST9Q5W186 159 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 LRRN1Q6UXK5 716 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 WDFY1Q8IWB7 410 aa3.26□□□□□ -1.89
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CCL20-204ENST00000489160 OR52P1PQ8NH57 321 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 CYGBQ8WWM9 190 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 PYDC1Q8WXC3 89 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 FMC1Q96HJ9 113 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 ZNF382Q96SR6 550 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 NOX3Q9HBY0 568 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 LRRC42Q9Y546 428 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 RGS12O14924 1447 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 PTPRGP23470 1445 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 C9orf84Q5VXU9 1444 aa3.26□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 CHD4Q14839 1912 aa3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa3.25□□□□□ -1.89
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CCL20-204ENST00000489160 NKX2-6A6NCS4 301 aa3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 METTL15A6NJ78 407 aa3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 H3BP45 60 aa3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 AZIN1O14977 448 aa3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 IFNA6P05013 189 aa3.25□□□□□ -1.89
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CCL20-204ENST00000489160 OR4Q2P0C623 313 aa3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 C8orf88P0DMB2 117 aa3.25□□□□□ -1.89
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CCL20-204ENST00000489160 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3.25□□□□□ -1.89
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CCL20-204ENST00000489160 IGFL2Q6UWQ7 119 aa3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 ZNF429Q86V71 674 aa3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 PCP2Q8IVA1 136 aa3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 ZNF645Q8N7E2 425 aa3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 OR8K1Q8NGG5 319 aa3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 STACQ99469 402 aa3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 HMG20AQ9NP66 347 aa3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 PARP11Q9NR21 331 aa3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 PSG11Q9UQ72 335 aa3.25□□□□□ -1.89
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CCL20-204ENST00000489160 IQGAP2Q13576 1575 aa3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 CARMIL3Q8ND23 1372 aa3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 ABCC11Q96J66 1382 aa3.25□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 PGPA6NDG6 321 aa3.24□□□□□ -1.89
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CCL20-204ENST00000489160 SPAG7O75391 227 aa3.24□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 SCO1O75880 301 aa3.24□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 OR2A4O95047 310 aa3.24□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 TNNC2P02585 160 aa3.24□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 OR4E1P0C645 316 aa3.24□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 ZNF688P0C7X2 276 aa3.24□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 ADORA1P30542 326 aa3.24□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 FAM3AP98173 230 aa3.24□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 TMED2Q15363 201 aa3.24□□□□□ -1.89
CCL20-204ENST00000489160 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.24□□□□□ -1.89
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