RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488576.5

FAM107B-222, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-222	ENST00000488576	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	OR8G5	Q8NG78	346 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ERMN	Q8TAM6	284 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	DCANP1	Q8TF63	244 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	GTF2H4	Q92759	462 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CERS2	Q96G23	380 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CPB2	Q96IY4	423 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	GPR22	Q99680	433 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	COPS4	Q9BT78	406 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	IL22	Q9GZX6	179 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	OR2D2	Q9H210	308 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ALG5	Q9Y673	324 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	NOS1	P29475	1434 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	NRCAM	Q92823	1304 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	MED13	Q9UHV7	2174 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	IGSF23	A1L1A6	192 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	MGAT4D	A6NG13	374 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576		B4DEV8	164 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576		I3L4J1	428 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576		M0QXV9	152 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	LECT2	O14960	151 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	GYG2	O15488	501 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CYTH3	O43739	400 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CRYGD	P07320	174 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	FBP1	P09467	338 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CECR9	P0C854	216 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	GIMD1	P0DJR0	217 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	PRKACA	P17612	351 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CCR7	P32248	378 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	G6PC	P35575	357 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	RANBP1	P43487	201 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	GPR4	P46093	362 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	HSPA13	P48723	471 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	RAP1GDS1	P52306	607 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	DSTN	P60981	165 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	TMEM258	P61165	79 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	LCN2	P80188	198 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF117	Q03924	483 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	STX4	Q12846	297 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	SKP2	Q13309	424 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	RAB11B	Q15907	218 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ATP6V1F	Q16864	119 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	RESP18	Q5W5W9	173 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ELP2	Q6IA86	826 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	COMMD1	Q8N668	190 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	OR51A7	Q8NH64	312 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	OR10A6	Q8NH74	314 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF563	Q8TA94	476 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	NELFB	Q8WX92	580 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	IFT81	Q8WYA0	676 aa		0.24	□□□□□ -2.37

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