RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486404.5

CHMP3-208, Transcript of charged multivesicular body protein 3, human

TSL 3

Gene CHMP3, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHMP3-208	ENST00000486404	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	SCN3B	Q9NY72	215 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	VGLL3	A8MV65	326 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	TOR1A	O14656	332 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	TSPAN9	O75954	239 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	HTR1D	P28221	377 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	KCNJ3	P48549	501 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	LINC00596	Q86U02	117 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	OSR2	Q8N2R0	312 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	DTX3	Q8N9I9	347 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	NEK7	Q8TDX7	302 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	MYDGF	Q969H8	173 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	CITED1	Q99966	193 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	IL36G	Q9NZH8	169 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	KIF25	Q9UIL4	384 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	TCF19	Q9Y242	345 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404		A0A1W2PPK0	400 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404		H0YHG0	523 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404		H3BUI4	141 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	CHST1	O43916	411 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	MMP23A	O75900	390 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	MAS1	P04201	325 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	CDK1	P06493	297 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	NFYB	P25208	207 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	PROK1	P58294	105 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	GPR176	Q14439	515 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	AWAT2	Q6E213	333 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	C11orf88	Q6PI97	169 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	TREML4	Q6UXN2	200 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM219	Q86XT9	240 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	CORO2A	Q92828	525 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	MUL1	Q969V5	352 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	DERL3	Q96Q80	235 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	PTGES3L	E9PB15	166 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	GTF2F2	P13984	249 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	CEACAM3	P40198	252 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	BDH1	Q02338	343 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	DOC2B	Q14184	412 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	MPV17L	Q2QL34	196 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	ASCL4	Q6XD76	172 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	CALY	Q9NYX4	217 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	LEUTX	A8MZ59	168 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	PEX14	O75381	377 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	GPX5	O75715	221 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	IL1A	P01583	271 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	CD1A	P06126	327 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	BRS3	P32247	399 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	GDNF	P39905	211 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	HSPA13	P48723	471 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	RAB13	P51153	203 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CHMP3-208	ENST00000486404	DYNLT3	P51808	116 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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