RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 F8VVB4 439 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 F8VWA3 439 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 TMPRSS2O15393 492 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ORC5O43913 435 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 GABRA2P47869 451 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 OR3A4PP47883 348 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 NPBWR2P48146 333 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 PITPNBP48739 271 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 RSU1Q15404 277 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 GRK1Q15835 563 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 AANATQ16613 207 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 CLLU1Q5K131 121 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 BATF2Q8N1L9 274 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 OR8H1Q8NGG4 311 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 AP3S1Q92572 193 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 MARVELD1Q9BSK0 173 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 METTL9Q9H1A3 318 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ING4Q9UNL4 249 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 TGFAP01135 160 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 MSMBP08118 114 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM157CP0CG43 387 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 CD37P11049 281 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ADRA2CP18825 462 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 AMY2BP19961 511 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 PRDX2P32119 198 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 MTNR1BP49286 362 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 GNB2P62879 340 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 IL13RA1P78552 427 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ELP2Q6IA86 826 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 LYPD6Q86Y78 171 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SDSLQ96GA7 329 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 DIRAS2Q96HU8 199 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 CNTD2Q9H8S5 307 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 IL36GQ9NZH8 169 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 CLN8Q9UBY8 286 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC23A1Q9UHI7 598 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF222Q9UK12 451 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 A8MXK9 166 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 PDCD5O14737 125 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SIGLEC5O15389 551 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFB3O43676 98 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SNAPINO95295 136 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SFTPBP07988 381 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ZP3P21754 424 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR176Q14439 515 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 PYDC2Q56P42 97 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SPIN3Q5JUX0 258 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 C1orf100Q5SVJ3 147 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIQKQ629K1 86 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 C22orf42Q6IC83 251 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 TEX261Q6UWH6 196 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 COMMD7Q86VX2 200 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 Q8NFD4 153 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM158Q8WZ71 300 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 GAFA1Q96PS6 74 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 CTSZQ9UBR2 303 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 LPAR3Q9UBY5 353 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SESN1Q9Y6P5 492 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 U3KQ87 197 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 FBN3Q75N90 2809 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SONP18583 2426 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 DVL1O14640 695 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR37O15354 613 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 CDRT1O95170 752 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 HTR3BO95264 441 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 IFNA7P01567 189 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 CHRM2P08172 466 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 RRASP10301 218 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ARSBP15848 533 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB14P61106 215 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 FGF12P61328 243 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 LCN2P80188 198 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF273Q14593 569 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF146Q15072 292 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC10Q5BKY1 277 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 CD276Q5ZPR3 534 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM166AQ6J272 317 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 GLCCI1Q86VQ1 547 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF561Q8N587 486 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 CD177Q8N6Q3 437 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 CREB3L1Q96BA8 519 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms