RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431283.1

PTPN4-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, human

TSL 3

Gene PTPN4, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN4-204	ENST00000431283	IL22RA2	Q969J5	263 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM54	Q969K7	222 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	MAL2	Q969L2	176 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TEX37	Q96LM6	180 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SAMD8	Q96LT4	415 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TBX15	Q96SF7	602 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283		Q9H3A6	140 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	NANS	Q9NR45	359 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	MMP26	Q9NRE1	261 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	AIG1	Q9NVV5	245 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CACNG2	Q9Y698	323 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	BTBD17	A6NE02	478 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	EVPLL	A8MZ36	301 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	UBD	O15205	165 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CHP2	O43745	196 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	NDUFA7	O95182	113 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TXNDC12	O95881	172 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	C1QC	P02747	245 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	PGA4	P0DJD7	388 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	PGA3	P0DJD8	388 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	HTR2A	P28223	471 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CD80	P33681	288 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	MPV17	P39210	176 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	STX1B	P61266	288 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	PPP1CB	P62140	327 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CDK6	Q00534	326 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ZMYND11	Q15326	602 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SGCA	Q16586	387 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TAF9	Q16594	264 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM86B	Q8N661	226 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	FNDC8	Q8TC99	324 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	MCHR2	Q969V1	340 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	UPRT	Q96BW1	309 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	RBP7	Q96R05	134 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OR8B2	Q96RD0	313 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SORT1	Q99523	831 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	MCHR1	Q99705	422 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ARHGDIG	Q99819	225 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CITED1	Q99966	193 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	NICN1	Q9BSH3	213 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CENPH	Q9H3R5	247 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	NRN1	Q9NPD7	142 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	INIP	Q9NRY2	104 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	MIOX	Q9UGB7	285 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	IL19	Q9UHD0	177 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF221	Q9UK13	617 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	C5orf63	A6NC05	138 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	LRRN3	E7EW58	273 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SDHD	O14521	159 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	PHYH	O14832	338 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	PIN1P1	O15428	100 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TPST1	O60507	370 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CST2	P09228	141 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97

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