RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 C20orf204Q6ZNR8 217 aa14.86□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 FAM216BQ8N7L0 139 aa14.86□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 ZNRF1Q8ND25 227 aa14.86□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 MMP28Q9H239 520 aa14.86□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 TMEM165Q9HC07 324 aa14.86□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 LRRK2Q5S007 2527 aa14.86□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 IFNL4K9M1U5 179 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 NAPSAO96009 420 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 DAOP14920 347 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 DTYMKP23919 212 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 LMO1P25800 156 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 GIFP27352 417 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 ZMYND11Q15326 602 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 GRK1Q15835 563 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 CARTPTQ16568 116 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 AVPI1Q5T686 147 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 TPRX1Q8N7U7 411 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 GAFA1Q96PS6 74 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 ZNF737O75373 536 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 RP2O75695 350 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 GLAP06280 429 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 AESQ08117 197 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 TMEM185AQ8NFB2 350 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 NRGNQ92686 78 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 COQ2Q96H96 371 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 CCL19Q99731 98 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 MAB21L2Q9Y586 359 aa14.85□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa14.84□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 AMY2AP04746 511 aa14.84□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 NAT1P18440 290 aa14.84□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 FAUP35544 74 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.84□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 ZNF497Q6ZNH5 498 aa14.84□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 FGFRL1Q8N441 504 aa14.84□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 OR5H2Q8NGV7 314 aa14.84□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 SHARPINQ9H0F6 387 aa14.84□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 LIME1Q9H400 295 aa14.84□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 KIF25Q9UIL4 384 aa14.84□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LTV1-201ENST00000367576 NKX6-3A6NJ46 265 aa14.83□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 CD74P04233 296 aa14.83□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 ARPC4P59998 168 aa14.83□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 BTG1P62324 171 aa14.83□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa14.83□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 LYPD2Q6UXB3 125 aa14.83□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.83□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 UBALD1Q8TB05 177 aa14.83□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 SLC6A7Q99884 636 aa14.83□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 ZNF665Q9H7R5 613 aa14.83□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.83□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 Q9N2K0 584 aa14.83□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 GLIPR1P48060 266 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 KRBOX4Q5JUW0 171 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 SHEQ5VZ18 495 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 ZNF788Q6ZQV5 615 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 SDSLQ96GA7 329 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 ANXA10Q9UJ72 324 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 MEIKINA0A087WXM9 373 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 NAP1L6A6NFF2 107 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 TMPRSS2O15393 492 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 SLC6A1P30531 599 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 OR3A3P47888 321 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 PLA1AQ53H76 456 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 ZNF561Q8N587 486 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 SNX22Q96L94 193 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 DCTN5Q9BTE1 182 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 DLL4Q9NR61 685 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 EHFQ9NZC4 300 aa14.82□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 COL12A1Q99715 3063 aa14.81□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 OVOL3O00110 214 aa14.81□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 PPIHO43447 177 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 ADAM20O43506 726 aa14.81□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 TK1P04183 234 aa14.81□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 ZNF735P0CB33 412 aa14.81□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 GSTT2P0CG29 244 aa14.81□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 EDDM3BP56851 147 aa14.81□□□□□ -0.04
LTV1-201ENST00000367576 TAS2R46P59540 309 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 167.2 ms