RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 LGALS4P56470 323 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF146Q15072 292 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 RSU1Q15404 277 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 GRK1Q15835 563 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ELP2Q6IA86 826 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TCF23Q7RTU1 214 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 RNF144BQ7Z419 303 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00596Q86U02 117 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SATL1Q86VE3 508 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SPARTQ8N0X7 666 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 CHST4Q8NCG5 386 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 LINC01006Q8NI28 216 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 AJUBAQ96IF1 538 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SNX22Q96L94 193 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF714Q96N38 554 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SSX3Q99909 188 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 FAM192AQ9GZU8 254 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 METTL9Q9H1A3 318 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 HMG20AQ9NP66 347 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 IL36GQ9NZH8 169 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 RNF114Q9Y508 228 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00312Q9Y6C7 94 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 hADV38S2A0JD32 116 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ODF3BA8MYP8 253 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 PDCD5O14737 125 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SH2D1BO14796 132 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 MGST3O14880 152 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 PSPNO60542 156 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SC5DO75845 299 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 CLPXO76031 633 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1D-12P01611 117 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 CSTBP04080 98 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 UCHL1P09936 223 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SRMP19623 302 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 MYL9P24844 172 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 PAX6P26367 422 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 MAP2K4P45985 399 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 OR3A1P47881 315 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 KCNJ3P48549 501 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 P2RX3P56373 397 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 IL13RA2Q14627 380 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 FAM189A2Q15884 450 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 AANATQ16613 207 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZSV7 163 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 CITED1Q99966 193 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 CST11Q9H112 138 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 PPA2Q9H2U2 334 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 KCNAB3O43448 404 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM127O75204 238 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 TSPAN9O75954 239 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 BPNT1O95861 308 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 OR2H2O95918 312 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 ARG1P05089 322 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 GTF2F2P13984 249 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 PROK1P58294 105 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 ZP1P60852 638 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 LY6EQ16553 131 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 PLA1AQ53H76 456 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF626Q68DY1 528 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 AWAT2Q6E213 333 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 TREML4Q6UXN2 200 aa6.21□□□□□ -1.42
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