RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 DANCRP0C864 163 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 GLI4P10075 376 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 SPP1P10451 314 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 TBC1D26Q86UD7 250 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 BATF2Q8N1L9 274 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 FAM96BQ9Y3D0 163 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 TECTAO75443 2155 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 CFAP54Q96N23 3096 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 NGFP01138 241 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 CD46P15529 392 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 GNG3P63215 75 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 CLN3Q13286 438 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 HMGN3Q15651 99 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 SPIN3Q5JUX0 258 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 DMBX1Q8NFW5 382 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 GP6Q9HCN6 339 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 TSPAN15O95858 294 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 SFTA3P0C7M3 94 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 CMTM1Q8IZ96 169 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 SECTM1Q8WVN6 248 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 PKIBQ9C010 78 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 CRIM1Q9NZV1 1036 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 SLC34A2O95436 690 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 HEXAP06865 529 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 SCTP09683 121 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 S100GP29377 79 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 IL24Q13007 206 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 J3QW42 95 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 PRKACAP17612 351 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM88Q6PEY1 159 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 OR1K1Q8NGR3 316 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 IL22RA2Q969J5 263 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 KIRREL1Q96J84 757 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 WFDC1Q9HC57 220 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 CLEC18AA5D8T8 446 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 NKX2-6A6NCS4 301 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 SLC22A20A6NK97 555 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 M0R296 226 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 CD80P33681 288 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 UCP2P55851 309 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 OR2C3Q8N628 320 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 CLEC18CQ8NCF0 446 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 BOD1Q96IK1 185 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 IFT22Q9H7X7 185 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 IL17BQ9UHF5 180 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 KPTNQ9Y664 436 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 SYNGR1O43759 233 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 UCP1P25874 307 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF266Q14584 549 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 FBXW9Q5XUX1 488 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 GAPTQ8N292 157 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 SUMF2Q8NBJ7 301 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 HS3ST6Q96QI5 342 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 SLC25A31Q9H0C2 315 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 C11orf1Q9H5F2 150 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 TNFSF15O95150 251 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 OR8U9P0C7N5 309 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 MMP9P14780 707 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 NPBWR1P48145 328 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 HERPUD1Q15011 391 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 PEA15Q15121 130 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 HFEQ30201 348 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 FAM58AQ8N1B3 248 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 OR8U1Q8NH10 309 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 WNT2BQ93097 391 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 SHANK1Q9Y566 2161 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 AGPAT2O15120 278 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 VDAC1P21796 283 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 SNCAP37840 140 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 WNT5AP41221 380 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 CAMLGP49069 296 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 NHLH2Q02577 135 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 TSC22D1Q15714 1073 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 CACFD1Q9UGQ2 172 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 PRSS50Q9UI38 385 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 FAM157AC9JC47 383 aa16.71■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 H0Y980 276 aa16.71■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 IL18BPO95998 194 aa16.71■□□□□ 0.27
SPNS1-201ENST00000311008 C3AR1Q16581 482 aa16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms