RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 NPFFO15130 113 aa18.17■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 IGHV1-8P0DP01 117 aa18.17■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 MGMTP16455 207 aa18.17■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 GUCA2AQ02747 115 aa18.17■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 KRBOX4Q5JUW0 171 aa18.17■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 SIGIRRQ6IA17 410 aa18.17■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 OR10K2Q6IF99 312 aa18.17■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 BRICD5Q6PL45 260 aa18.17■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 Q6YL49 198 aa18.17■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 C17orf50Q8WW18 174 aa18.17■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 SLITRK2Q9H156 845 aa18.17■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 KCNK15Q9H427 330 aa18.17■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa18.17■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 ING3Q9NXR8 418 aa18.17■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa18.16■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 RNF212BA8MTL3 300 aa18.16■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 HTR2CP28335 458 aa18.16■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 UNC119Q13432 240 aa18.16■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 TMEM158Q8WZ71 300 aa18.16■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 DUX5Q96PT3 197 aa18.16■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 SELENOIQ9C0D9 397 aa18.16■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 FUOMA2VDF0 154 aa18.15■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa18.15■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 TMEM14DPA8MWL7 114 aa18.15■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 SLC17A2O00624 439 aa18.15■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 GDNFP39905 211 aa18.15■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 UBA52P62987 128 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 BAMBIQ13145 260 aa18.15■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 SLC9A3R2Q15599 337 aa18.15■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa18.15■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 OR6M1Q8NGM8 313 aa18.15■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 ZFAND2BQ8WV99 257 aa18.15■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 FAM46BQ96A09 425 aa18.15■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 JMJD8Q96S16 334 aa18.15■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa18.15■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R3Q9NYW6 316 aa18.15■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 KIF25Q9UIL4 384 aa18.15■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa18.14■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PPE2 198 aa18.14■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PR64 198 aa18.14■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PRV1 198 aa18.14■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 TRIM64CA6NLI5 447 aa18.14■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 TNFAIP8O95379 198 aa18.14■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 UBBP0CG47 229 aa18.14■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 SAA4P35542 130 aa18.14■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 KCNJ3P48549 501 aa18.14■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 NEDD8Q15843 81 aa18.14■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 C17orf58Q2M2W7 97 aa18.14■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 C22orf42Q6IC83 251 aa18.14■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 NR2C2APQ86WQ0 139 aa18.14■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 OR13A1Q8NGR1 328 aa18.14■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 BARHL1Q9BZE3 327 aa18.14■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 ZNF696Q9H7X3 374 aa18.14■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM90A10PA6NDY2 464 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM90A18PA6NE21 464 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM90A16PA6NEW6 464 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM90A7PA6NKC0 464 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM90A22PA8MWA6 464 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM90A12PA8MX19 464 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 CLDN34H7C241 214 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 MELTFP08582 738 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM90A15PP0C7V4 464 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM90A13PP0C7W8 464 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM90A14PP0C7W9 464 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM90A24PP0C7X0 464 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 ATAD3CQ5T2N8 411 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 TSPAN14Q8NG11 270 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM216AQ8WUB2 273 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 C19orf24Q9BVV8 132 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 OR51E2Q9H255 320 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 STUB1Q9UNE7 303 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 V9GY05 133 aa18.13■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 MEIOCA2RUB1 952 aa18.12■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 ODF3BA8MYP8 253 aa18.12■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 BPNT1O95861 308 aa18.12■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 MPIG6BO95866 241 aa18.12■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 COX7A1P24310 79 aa18.12■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 OR10A3P58181 314 aa18.12■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 P2RY14Q15391 338 aa18.12■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 MIDNQ504T8 468 aa18.12■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 UTF1Q5T230 341 aa18.12■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 SLC35E4Q6ICL7 350 aa18.12■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 HEPN1Q6WQI6 88 aa18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms