RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 RNF133Q8WVZ7 376 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 OR10C1Q96KK4 312 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 VAX2Q9UIW0 290 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 SCN4AP35499 1836 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 CYR61O00622 381 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 SLC37A1P57057 533 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PKIAP61925 76 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 FBXL17Q9UF56 701 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 FCN1O00602 326 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 LYZL6O75951 148 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 IRF3Q14653 427 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 DTD1Q8TEA8 209 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 CCL17Q92583 94 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 FAM210BQ96KR6 192 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 ABHD1Q96SE0 405 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PARP11Q9NR21 331 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 GYPAP02724 150 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 METAP1P53582 386 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 ERVFRD-1P60508 538 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 ZNF441Q8N8Z8 693 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 MS4A10Q96PG2 267 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 KCNK15Q9H427 330 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 RNF122Q9H9V4 155 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 TAF1P21675 1872 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 F5H697 171 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 VDAC1P21796 283 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 COX7A1P24310 79 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 FDX2Q6P4F2 183 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 OR8D4Q8NGM9 314 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 RAB24Q969Q5 203 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 GPR27Q9NS67 375 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.35□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 AP4M1O00189 453 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 NEURL1O76050 574 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 P01737 135 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 OR5AL1P0C617 328 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PPOXP50336 477 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PAFAH1B2P68402 229 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 ORAI1Q96D31 301 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PLXNB2O15031 1838 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 A0A0U1RQV5 110 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 HELTA6NFD8 242 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 FAM74A7A6NL05 159 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 CORTO00230 105 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 ISLRO14498 428 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 GNG7O60262 68 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 GLI4P10075 376 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 MYF5P13349 255 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 HOGA1Q86XE5 327 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 ZNF721Q8TF20 911 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 FZR1Q9UM11 496 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 H3BP45 60 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PGA4P0DJD7 388 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 PGA5P0DJD9 388 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 OR10J1P30954 320 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 ELOBQ15370 118 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 UBALD1Q8TB05 177 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 WNK3Q9BYP7 1800 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa6.34□□□□□ -1.39
CPS1-201ENST00000233072 LNP1A1A4G5 178 aa6.34□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SP6Q3SY56 376 aa6.34□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CALHM1Q8IU99 346 aa6.34□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa6.34□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.34□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.34□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 AMER3Q8N944 861 aa6.34□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.34□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.34□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.34□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.34□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.34□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 V9GYH0 126 aa6.34□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 DSPPQ9NZW4 1301 aa6.34□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 A0A1W2PNV4 684 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms