RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004097.15

Cux1-201, Transcript of Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cux1, Length 12,862 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cox20Q9D7J4 117 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rfx5Q9JL61 658 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 SrpxQ9R0M3 464 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Phxr2P15972 65 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olig3Q6PFG8 273 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cpeb3Q7TN99 716 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1026Q7TR90 307 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Zfp955aQ80XR7 545 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1336Q8VGH5 314 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ranbp3Q9CT10 491 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 1700018B08RikQ9DA83 213 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Slc37a2Q9WU81 501 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 StrapQ9Z1Z2 350 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cep290Q6A078 2472 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Trbv21A0A0A6YX06 97 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gpr33O88416 339 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 CrpP14847 225 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Twist1P26687 206 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Col9a1Q05722 921 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Selenbp2Q63836 472 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tra2aQ6PFR5 281 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Morn4Q6PGF2 146 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tm4sf5Q91XF2 196 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Prss28Q924N9 274 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Klk10Q99M20 278 aa7.4□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 CymB7ZWD6 379 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Coq10aE9Q3H6 259 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cst3P21460 140 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 CapzbP47757 277 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Il12rb1Q60837 738 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 AstlQ6HA09 435 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Slco1a4Q9EP96 670 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr959Q9EQ86 311 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Elovl1Q9JLJ5 279 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Fer1l6E0CZ42 1862 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tnfaip6O08859 275 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Sult2a1P52843 285 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 AdipoqQ60994 247 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Mex3bQ69Z36 601 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gtdc1Q8BW56 445 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Zfp446Q8C9M8 523 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gsg1Q8R1W2 324 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1259Q8VEZ1 309 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ythdf2Q91YT7 579 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Chrnb2Q9ERK7 501 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Brwd3A2AHJ4 1799 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Plscr5J3QM92 274 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rplp1P47955 114 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tmem179bQ9CY24 219 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1189A2AV11 306 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Zbtb25G3UW50 439 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tnfsf12O54907 249 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Megf11Q80T91 1091 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Neurl2Q9D0S4 285 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Isca2Q9DCB8 154 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Slurp1Q9Z0K7 110 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm9964E9Q9S5 144 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cd59aO55186 123 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 CapgP24452 352 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cnr2P47936 347 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 StsP50427 624 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Npdc1Q64322 332 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr994Q8VF73 314 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Iqcf5Q9DAL7 148 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 HcstQ9QUJ0 79 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Lhx9Q9WUH2 397 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1438-ps1A0A140LHS9 319 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm5475D3YV11 175 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1222Q7TR02 311 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr645Q7TRQ1 315 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tmem106cQ80VP8 260 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 TprkbQ8QZZ7 175 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr969Q8VG89 311 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Btf3l4Q9CQH7 158 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ptges3lQ9D9A7 131 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Spint1Q9R097 507 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Vmn1r16K7N775 303 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Nkx2-1P50220 372 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ccr8P56484 353 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Lrrc28Q3TX51 367 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tmem184aQ3UFJ6 425 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Slc25a31Q3V132 320 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1434Q7TQR9 312 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Actbl2Q8BFZ3 376 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Adam4Q8CGQ2 763 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Stac2Q8R1B0 408 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr57Q8VGU7 319 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Klrc1Q9Z202 244 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ttc3O88196 1979 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Fam90a1aA2A4E2 429 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 HcrtO55241 130 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 SbpP15501 199 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gabarapl2P60521 117 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Il11ra2P70225 432 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Spem1Q5F289 310 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Fam189bQ5HZJ5 669 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Adam12Q61824 903 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Taf9bQ6NZA9 249 aa7.39□□□□□ -1.23
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pgr15lQ80T54 456 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 120.8 ms