RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	LRRC24	Q50LG9	513 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	ELP1	O95163	1332 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	KRT222	Q8N1A0	295 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	SNRK	Q9NRH2	765 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	STK38	Q15208	465 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		11.71	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		11.71	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	IL17RA	Q96F46	866 aa		11.71	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	IQCB1	Q15051	598 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	EPC1	Q9H2F5	836 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	ANO10	Q9NW15	660 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	DNAI1	Q9UI46	699 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	EXOC5	O00471	708 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	KCNQ2	O43526	872 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	FOXO4	P98177	505 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	UTY	O14607	1347 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	RXRA	P19793	462 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	NDUFA8	P51970	172 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	CASP7	P55210	303 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	PDILT	Q8N807	584 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	CCZ1B	P86790	482 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	KRT32	Q14532	448 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	SNAP23	O00161	211 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	ATP1A3	P13637	1013 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	MNS1	Q8NEH6	495 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	CPLX1	O14810	134 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	SLFN14	P0C7P3	912 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	CLIC4	Q9Y696	253 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	SERPINC1	P01008	464 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	COL15A1	P39059	1388 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	ATP2B1	P20020	1258 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	TERF2	Q15554	542 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	CFAP100	Q494V2	611 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	PI16	Q6UXB8	463 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	CTDNEP1	O95476	244 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	C8orf37	Q96NL8	207 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482		H7C1W4	665 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	NRDC	O43847	1150 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	ERO1A	Q96HE7	468 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	KCNB2	Q92953	911 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	ADORA1	P30542	326 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	SPECC1	Q5M775	1068 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	UBXN4	Q92575	508 aa		11.65	□□□□□ -0.54

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