RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 MCAMP43121 646 aa24■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 RAB3GAP1Q15042 981 aa24■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 CCDC93Q567U6 631 aa24■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 SYT17Q9BSW7 474 aa24■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 BCS1LQ9Y276 419 aa24■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 SNED1Q8TER0 1413 aa24■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 RIMBP2O15034 1052 aa23.99■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 PI16Q6UXB8 463 aa23.98■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 CHD4Q14839 1912 aa23.98■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 MED23Q9ULK4 1368 aa23.98■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.98■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.98■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.98■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 RASGRF1Q13972 1273 aa23.97■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 WASHC4Q2M389 1173 aa23.97■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.97■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.97■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 CNTROBQ8N137 903 aa23.97■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 ST18O60284 1047 aa23.96■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 ZAP70P43403 619 aa23.96■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 SOGA3Q5TF21 947 aa23.96■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.96■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 GBP4Q96PP9 640 aa23.96■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.96■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 GOLIM4O00461 696 aa23.96■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 EYA3Q99504 573 aa23.96■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.96■■□□□ 1.43
CLN8-208ENST00000635751 CHMLP26374 656 aa23.95■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 SPATA5Q8NB90 893 aa23.95■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 EVI5LQ96CN4 794 aa23.95■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.95■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 MYH7P12883 1935 aa23.94■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 TRAK2O60296 914 aa23.94■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.94■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 CD209Q9NNX6 404 aa23.94■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 PSMD1Q99460 953 aa23.93■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 PTMSP20962 102 aa23.92■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 MCCP23508 829 aa23.92■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.92■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.92■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 DOK7Q18PE1 504 aa23.91■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 SEMA3EO15041 775 aa23.91■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 IL1R1P14778 569 aa23.91■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 AOC3Q16853 763 aa23.91■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 FSD1Q9BTV5 496 aa23.91■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 COA1Q9GZY4 146 aa23.91■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 DOCK2Q92608 1830 aa23.9■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 G3V3G9 751 aa23.9■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.9■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.89■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 JAG2Q9Y219 1238 aa23.89■■□□□ 1.42
CLN8-208ENST00000635751 PPIP5K2O43314 1243 aa23.89■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.89■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.89■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 ANAPC15P60006 121 aa23.88■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 SCN9AQ15858 1988 aa23.88■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 NFKBIEO00221 500 aa23.87■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 ZBTB22O15209 634 aa23.87■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 UTRNP46939 3433 aa23.87■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.87■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.87■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 CLEC17AQ6ZS10 378 aa23.87■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.86■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 NUCB2P80303 420 aa23.85■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 IL17RAQ96F46 866 aa23.85■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 ABCF2Q9UG63 623 aa23.85■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 ECE2O60344 883 aa23.84■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 IDH1O75874 414 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 CHGBP05060 677 aa23.84■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 MCM2P49736 904 aa23.84■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 PODNQ7Z5L7 613 aa23.84■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.84■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 VPS33BQ9H267 617 aa23.84■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.84■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 GTF2IP78347 998 aa23.83■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 RASSF7Q02833 373 aa23.83■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.83■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.83■■□□□ 1.41
CLN8-208ENST00000635751 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms