RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 CSF1RP07333 972 aa34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 CERS5Q8N5B7 392 aa34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP100Q494V2 611 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAAF4Q8WXU2 420 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 CASP7P55210 303 aa34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP3K11Q16584 847 aa34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF804AQ7Z570 1209 aa34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 LINS1Q8NG48 757 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 JAG2Q9Y219 1238 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP34.88■■■■□ 3.175e-7■■■■□ 22.6
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP34.88■■■■□ 3.172e-8■■■□□ 16.5
CAPNS1-217ENST00000629983 OTOP1Q7RTM1 612 aa34.88■■■■□ 3.17
CAPNS1-217ENST00000629983 MTMR14Q8NCE2 650 aa34.88■■■■□ 3.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SSC5DA1L4H1 1573 aa34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-217ENST00000629983 IREB2P48200 963 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-217ENST00000629983 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SPDYE2BA6NHP3 402 aa34.86■■■■□ 3.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SPDYE6P0CI01 402 aa34.86■■■■□ 3.17
CAPNS1-217ENST00000629983 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa34.86■■■■□ 3.17
CAPNS1-217ENST00000629983 GCC1Q96CN9 775 aa34.86■■■■□ 3.17
CAPNS1-217ENST00000629983 ERO1AQ96HE7 468 aa34.86■■■■□ 3.17
CAPNS1-217ENST00000629983 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-217ENST00000629983 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-217ENST00000629983 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-217ENST00000629983 WWC1Q8IX03 1113 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PLIN1O60240 522 aa34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-217ENST00000629983 CD99L2Q8TCZ2 262 aa34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-217ENST00000629983 IRS2Q9Y4H2 1338 aa34.82■■■■□ 3.17
CAPNS1-217ENST00000629983 IL1R1P14778 569 aa34.82■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF7LQ5H9L4 462 aa34.82■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 POTEFA5A3E0 1075 aa34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 UNCXA6NJT0 531 aa34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 CRHR2Q13324 411 aa34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC27Q2M243 656 aa34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 RASA3Q14644 834 aa34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 AOX1Q06278 1338 aa34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 GJA5P36382 358 aa34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 EFCC1Q9HA90 598 aa34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 USP2O75604 605 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXO4P98177 505 aa34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPN22Q9Y2R2 807 aa34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC57Q2TAC2 916 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 LMBR1LQ6UX01 489 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ELP3Q9H9T3 547 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 CNNM1Q9NRU3 951 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 IL16Q14005 1332 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFAIP1Q13829 316 aa34.76■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa34.76■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SP3Q02447 781 aa34.75■■■■□ 3.15
CAPNS1-217ENST00000629983 FANCIQ9NVI1 1328 aa34.75■■■■□ 3.15
CAPNS1-217ENST00000629983 F6X3S4 739 aa34.74■■■■□ 3.15
CAPNS1-217ENST00000629983 OPTNQ96CV9 577 aa34.74■■■■□ 3.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
CAPNS1-217ENST00000629983 MFSD14BQ5SR56 506 aa34.72■■■■□ 3.15
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPN18Q99952 460 aa34.72■■■■□ 3.15
CAPNS1-217ENST00000629983 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
CAPNS1-217ENST00000629983 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-217ENST00000629983 SPDYE2Q495Y8 402 aa34.7■■■■□ 3.15
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC184Q52MB2 194 aa34.7■■■■□ 3.15
CAPNS1-217ENST00000629983 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
CAPNS1-217ENST00000629983 BEND3Q5T5X7 828 aa34.7■■■■□ 3.15
CAPNS1-217ENST00000629983 EPHA10Q5JZY3 1008 aa34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ARMC5Q96C12 935 aa34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TCP10L2B9ZVM9 353 aa34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 VAMP4O75379 141 aa34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 EN2P19622 333 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ECM29Q5VYK3 1845 aa34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM205AQ6ZU69 1335 aa34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM106CQ9BVX2 250 aa34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINA10Q9UK55 444 aa34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 GYG1P46976 350 aa34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 GRM8O00222 908 aa34.66■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF6Q15052 776 aa34.66■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TNNI2P48788 182 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 CCL15Q16663 113 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 CDAN1Q8IWY9 1227 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE4AQ14139 1066 aa34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 BRI3BPQ8WY22 251 aa34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM39BQ9GZU3 492 aa34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-217ENST00000629983 CSADQ9Y600 493 aa34.64■■■■□ 3.14
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