RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619193.4

RDM1-223, Transcript of RAD52 motif containing 1, human

TSL 1 (best)

Gene RDM1, Length 686 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDM1-223	ENST00000619193	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	FERMT3	Q86UX7	667 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	GPATCH3	Q96I76	525 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	7.04	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	NBPF26	B4DH59	902 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193		H7C1W4	665 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	CYP27B1	O15528	508 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	PTGS1	P23219	599 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	CDC25B	P30305	580 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	TIE1	P35590	1138 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	EVC	P57679	992 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	KRT85	P78386	507 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	SCRN1	Q12765	414 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	MAP3K11	Q16584	847 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	SARM1	Q6SZW1	724 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	COPS6	Q7L5N1	327 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	LUZP1	Q86V48	1076 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	NBPF15	Q8N660	670 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	BRF1	Q92994	677 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	MYD88	Q99836	296 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	FSD1	Q9BTV5	496 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	DACT1	Q9NYF0	836 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	USP16	Q9Y5T5	823 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RDM1-223	ENST00000619193	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	NR1I2	O75469	434 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	TPM3	P06753	285 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	CCDC192	P0DO97	292 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	PSME1	Q06323	249 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	LRMP	Q12912	555 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	ANKRD1	Q15327	319 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	TICAM2	Q86XR7	235 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	FBXL16	Q8N461	479 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	NEK1	Q96PY6	1258 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	SIL1	Q9H173	461 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	GPR108	Q9NPR9	543 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	KCND1	Q9NSA2	647 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	CPD	O75976	1380 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	FAM177B	A6PVY3	158 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	PDC	P20941	246 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	ATP2B3	Q16720	1220 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193		Q6ZUG5	572 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	MAST3	O60307	1309 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		7	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193		M0R2C6	588 aa		7	□□□□□ -1.29
RDM1-223	ENST00000619193	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29

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