RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 RHOXF2BP0C7M4 288 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 HOXC9P31274 260 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 ATP2B2Q01814 1243 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 TADA2BQ86TJ2 420 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 CNTROBQ8N137 903 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 DHX58Q96C10 678 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 RHOXF2Q9BQY4 288 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 SALL3Q9BXA9 1300 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 ATP1A3P13637 1013 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 GSDMDP57764 484 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 GUCY1B3Q02153 619 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 DPCR1Q3MIW9 517 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 IQUBQ8NA54 791 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 DESI2Q9BSY9 194 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 USP6P35125 1406 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 CEP57L1Q8IYX8 460 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 TEFQ10587 303 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 RPAINQ86UA6 219 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 RNF217Q8TC41 542 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 DPF2Q92785 391 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 PNKPQ96T60 521 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 SDF4Q9BRK5 362 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 EHD4Q9H223 541 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 FAM204AQ9H8W3 233 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 ABCB6Q9NP58 842 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 H3BQV1 296 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 KINO60870 393 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 SATB1Q01826 763 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 IFFO2Q5TF58 517 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 EGFL6Q8IUX8 553 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 PDILTQ8N807 584 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 BRF1Q92994 677 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 PSD3Q9NYI0 1048 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 FRMD3A2A2Y4 597 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 GOLIM4O00461 696 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 ERLIN2O94905 339 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 GSCP56915 257 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 KCNV1Q6PIU1 500 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 ANO10Q9NW15 660 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 STAP2Q9UGK3 403 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 SBNO1A3KN83 1393 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGEF10O15013 1369 aa9.44□□□□□ -0.9
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PTPRT-211ENST00000618610 NRDCO43847 1150 aa9.43□□□□□ -0.9
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PTPRT-211ENST00000618610 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
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PTPRT-211ENST00000618610 FSIP1Q8NA03 581 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC2Q9BYS8 371 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 A0A0U1RQJ8 604 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1B0GVL5 298 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 VWA3AA6NCI4 1184 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM232C9JQI7 657 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 ATP8B1O43520 1251 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 CCT5P48643 541 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 FAM182BQ5T319 152 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 VPS53Q5VIR6 699 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
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PTPRT-211ENST00000618610 CCDC150Q8NCX0 1101 aa9.43□□□□□ -0.9
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PTPRT-211ENST00000618610 ATRIPQ8WXE1 791 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 SGSM3Q96HU1 749 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 HINFPQ9BQA5 517 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 IGSF1Q8N6C5 1336 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 IRF6O14896 467 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 ME1P48163 572 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 BIRC2Q13490 618 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 SSH3Q8TE77 659 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 BTBD11A6QL63 1104 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 HSP90B2PQ58FF3 399 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 GOLGA1Q92805 767 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 TTC41PQ6P2S7 1318 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 ADCY9O60503 1353 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 EXOC5O00471 708 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 MAP2K7O14733 419 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRT-211ENST00000618610 TPM1P09493 284 aa9.42□□□□□ -0.9
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