RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 BACH1O14867 736 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 DHX58Q96C10 678 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 USP21Q9UK80 565 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGEF10O15013 1369 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 ADCY5O95622 1261 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 FAM212AQ96EL1 285 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 UBASH3AP57075 661 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 APOBRQ0VD83 1088 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 TSNARE1Q96NA8 513 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 SHTN1A0MZ66 631 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 RAD50Q92878 1312 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 DCTPP1Q9H773 170 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 EYA2O00167 538 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 POTEB2H3BUK9 544 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 TTC16Q8NEE8 873 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 PSMD1Q99460 953 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 FSD2A1L4K1 749 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 SP4Q02446 784 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 MCM7P33993 719 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 UBE4AQ14139 1066 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 UVSSAQ2YD98 709 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 SPTLC2O15270 562 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 KIF4AO95239 1232 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 A0A1B0GUL7 405 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 RGS22Q8NE09 1264 aa22.89■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 SLAIN2Q9P270 581 aa22.89■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 APBA3O96018 575 aa22.89■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.89■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 HOOK2Q96ED9 719 aa22.89■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 F13A1P00488 732 aa22.89■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 IKBKGQ9Y6K9 419 aa22.89■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 DPH6Q7L8W6 267 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 WDR62O43379 1518 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 CALRP27797 417 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 INCENPQ9NQS7 918 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 BAG6P46379 1132 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 RTL1A6NKG5 1358 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 PIK3C2GO75747 1445 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 BICDL2A1A5D9 508 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 RXRAP19793 462 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 HOXB7P09629 217 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 PDE6BP35913 854 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 DDX12PQ92771 950 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 TESK2Q96S53 571 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 PRPHP41219 470 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 TAF12Q16514 161 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 CERS3Q8IU89 383 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 RUFY3Q7L099 469 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 USP48Q86UV5 1035 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 GNG11P61952 73 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 TIMM10P62072 90 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 AK2P54819 239 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 TNNI3KQ59H18 835 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms