RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 SASH1O94885 1247 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 ADORA1P30542 326 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 GRIK5Q16478 980 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 CNTROBQ8N137 903 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 USP17L3A6NCW0 530 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 USP17L4A6NCW7 530 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 RGS3P49796 1198 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 CHADLQ6NUI6 762 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 USP17L1Q7RTZ2 530 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 CERS5Q8N5B7 392 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 DDRGK1Q96HY6 314 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 MED23Q9ULK4 1368 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 PDE8BO95263 885 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 TFCP2Q12800 502 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 H7C1D1 291 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC4A3P48751 1232 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 NBPF9Q3BBW0 867 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 VGLL2Q8N8G2 317 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR90Q96KV7 1748 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 AOX1Q06278 1338 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 DACT2Q5SW24 774 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 IRS2Q9Y4H2 1338 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 VIL1P09327 827 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 PODNQ7Z5L7 613 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 NEUROD6Q96NK8 337 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 COA1Q9GZY4 146 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 ADM5C9JUS6 153 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 LDHDQ86WU2 507 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 VPS33BQ9H267 617 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 FZD1Q9UP38 647 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 MROH5Q6ZUA9 1318 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 USP17L8P0C7I0 530 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 C8orf34Q49A92 452 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF804AQ7Z570 1209 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 USP48Q86UV5 1035 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 SURF6O75683 361 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 PI16Q6UXB8 463 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 GGA3Q9NZ52 723 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP15.4■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP2B3Q16720 1220 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 PHKA1P46020 1223 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 MVPQ14764 893 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 MFSD14BQ5SR56 506 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 CENPFP49454 3210 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 CLRN2A0PK11 232 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 PRKG1Q13976 671 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
RABGEF1-209ENST00000607882 UBE4AQ14139 1066 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 SCARF1Q14162 830 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 IL27Q8NEV9 243 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 MYOZ2Q9NPC6 264 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 GMLQ99445 158 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 STRIP1Q5VSL9 837 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP85Q6P2H3 762 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 KRT26Q7Z3Y9 468 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 COPRSQ9NQ92 184 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1B0GUL7 405 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 APLP1P51693 650 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 CACNB3P54284 484 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 FSTL1Q12841 308 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 CAVIN4Q5BKX8 364 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 OGFOD1Q8N543 542 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 SIRT2Q8IXJ6 389 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 DPF2Q92785 391 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 SNRKQ9NRH2 765 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 SCN4AP35499 1836 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 FGFR2P21802 821 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 MOB2Q70IA6 237 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1B0GUL6 1792 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 WNT10BO00744 389 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 CELF2O95319 508 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC5A1P13866 664 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 IL1R1P14778 569 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 IL15P40933 162 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP8B2P98198 1209 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms