RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598968.5

TIMM44-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, human

TSL 3

Gene TIMM44, Length 797 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM44-208	ENST00000598968	POLA2	Q14181	598 aa		28.03	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		28.03	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		28.03	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	TFCP2	Q12800	502 aa		28.02	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	SSH3	Q8TE77	659 aa		28.02	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		28.01	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	CERS5	Q8N5B7	392 aa		28.01	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		28.01	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968		F8W031	263 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	MMP14	P50281	582 aa		28	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	SCARF1	Q14162	830 aa		28	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		28	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	CEP85	Q6P2H3	762 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	TRAF5	O00463	557 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	TIMM10	P62072	90 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	27.97	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	USP48	Q86UV5	1035 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	CREBZF	Q9NS37	354 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	GGA3	Q9NZ52	723 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TIMM44-208	ENST00000598968		A0A1B0GUL7	405 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	ADORA1	P30542	326 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	SULF1	Q8IWU6	871 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	DLGAP5	Q15398	846 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	WNT10B	O00744	389 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	PHKA1	P46020	1223 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	27.92	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	XAGE2	Q96GT9	111 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	ADM5	C9JUS6	153 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	GORAB	Q5T7V8	394 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	CCDC102B	Q68D86	513 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	CFAP100	Q494V2	611 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	DLK2	Q6UY11	383 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	HMMR	O75330	724 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	CST9	Q5W186	159 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TIMM44-208	ENST00000598968	SEMA3E	O15041	775 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	MYO1B	O43795	1136 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	GRIK5	Q16478	980 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	KLRG1	Q96E93	195 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	TNNI3K	Q59H18	835 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	GPR108	Q9NPR9	543 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	SPDYE6	P0CI01	402 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	CRK	P46108	304 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	CDCA5	Q96FF9	252 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	MAST3	O60307	1309 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TIMM44-208	ENST00000598968	RASGRF1	Q13972	1273 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TIMM44-208	ENST00000598968	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TIMM44-208	ENST00000598968	TEKT1	Q969V4	418 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TIMM44-208	ENST00000598968	CLRN2	A0PK11	232 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TIMM44-208	ENST00000598968	APBB1	O00213	710 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TIMM44-208	ENST00000598968	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
TIMM44-208	ENST00000598968	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		27.81	■■■□□ 2.04

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