RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593111.1

PSME3-216, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene PSME3, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-216ENST00000593111 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.23■■□□□ 1.15
PSME3-216ENST00000593111 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.23■■□□□ 1.15
PSME3-216ENST00000593111 F6X3S4 739 aa22.22■■□□□ 1.15
PSME3-216ENST00000593111 MYO1BO43795 1136 aa22.22■■□□□ 1.15
PSME3-216ENST00000593111 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PSME3-216ENST00000593111 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.22■■□□□ 1.15
PSME3-216ENST00000593111 CLRN2A0PK11 232 aa22.21■■□□□ 1.15
PSME3-216ENST00000593111 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PSME3-216ENST00000593111 ALDH1A1P00352 501 aa22.21■■□□□ 1.15
PSME3-216ENST00000593111 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PSME3-216ENST00000593111 CFAP100Q494V2 611 aa22.21■■□□□ 1.15
PSME3-216ENST00000593111 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.21■■□□□ 1.15
PSME3-216ENST00000593111 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.21■■□□□ 1.15
PSME3-216ENST00000593111 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PSME3-216ENST00000593111 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.21■■□□□ 1.15
PSME3-216ENST00000593111 VEZTQ9HBM0 779 aa22.21■■□□□ 1.15
PSME3-216ENST00000593111 JAG2Q9Y219 1238 aa22.21■■□□□ 1.15
PSME3-216ENST00000593111 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 IL1R1P14778 569 aa22.2■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 INHBEP58166 350 aa22.2■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.2■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.2■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.2■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.2■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 BEND3Q5T5X7 828 aa22.19■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.19■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 WDR63Q8IWG1 891 aa22.19■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.19■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.19■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.19■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.18■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 SPDYE6P0CI01 402 aa22.18■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 IFNL1Q8IU54 200 aa22.18■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 MRS2Q9HD23 443 aa22.18■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.18■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 MAP3K11Q16584 847 aa22.17■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.17■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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PSME3-216ENST00000593111 WNK4Q96J92 1243 aa22.17■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 CACNA1FO60840 1977 aa22.16■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 GRM8O00222 908 aa22.15■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 RASA3Q14644 834 aa22.15■■□□□ 1.14
PSME3-216ENST00000593111 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 TRIM17Q9Y577 477 aa22.14■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 AOX1Q06278 1338 aa22.13■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 UNCXA6NJT0 531 aa22.13■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.13■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.13■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.12■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.12■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.11■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 GYG1P46976 350 aa22.11■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.11■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.11■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.1■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 UBE4AQ14139 1066 aa22.1■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 A0A1B0GUL6 1792 aa22.1■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 ALDH1L1O75891 902 aa22.09■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 GJA5P36382 358 aa22.09■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 TNFAIP1Q13829 316 aa22.09■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 ERO1AQ96HE7 468 aa22.09■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.09■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 ELP3Q9H9T3 547 aa22.09■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 CRHR2Q13324 411 aa22.08■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.08■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.08■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.08■■□□□ 1.13
PSME3-216ENST00000593111 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.07■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 ANP32CO43423 234 aa22.07■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 OPTNQ96CV9 577 aa22.07■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 PTPN18Q99952 460 aa22.07■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 VPS37DQ86XT2 251 aa22.06■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 SUCLG2Q96I99 432 aa22.06■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.06■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 SP3Q02447 781 aa22.05■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 EFCC1Q9HA90 598 aa22.05■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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