RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589998.5

ILF3-217, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ILF3, Length 2,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-217ENST00000589998 FOXO4P98177 505 aa23.12■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 BPIFA3Q9BQP9 254 aa23.12■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 IFNKQ9P0W0 207 aa23.12■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 ARMCX5Q6P1M9 558 aa23.12■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 TMC6Q7Z403 805 aa23.12■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 KRT222Q8N1A0 295 aa23.12■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 M0R2C6 588 aa23.12■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 SLFN14P0C7P3 912 aa23.11■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.11■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.11■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa23.11■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 SPEF2Q9C093 1822 aa23.11■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.11■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.11■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 MEGF6O75095 1541 aa23.1■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 EVCP57679 992 aa23.1■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.1■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 GPR108Q9NPR9 543 aa23.1■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.1■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 BIN1O00499 593 aa23.1■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 C8orf76Q96K31 380 aa23.1■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.1■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.1■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 YEATS4O95619 227 aa23.09■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 TICAM2Q86XR7 235 aa23.09■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 FBXL16Q8N461 479 aa23.09■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 FAM53CQ9NYF3 392 aa23.09■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 SPTLC2O15270 562 aa23.09■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 L2HGDHQ9H9P8 463 aa23.09■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 TJP1Q07157 1748 aa23.08■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.08■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
ILF3-217ENST00000589998 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 H7C1W4 665 aa23.08■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 NLRP12P59046 1061 aa23.08■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.08■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 GLI3P10071 1580 aa23.07■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 NCAPHQ15003 741 aa23.07■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 LRRC24Q50LG9 513 aa23.07■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.07■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.07■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.07■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 OSBP2Q969R2 916 aa23.07■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 NPHP1O15259 732 aa23.07■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 ZNF202O95125 648 aa23.07■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 HAND2P61296 217 aa23.07■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.07■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 TERF2Q15554 542 aa23.06■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 A0A1B0GUL7 405 aa23.06■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 KCNJ6P48051 423 aa23.06■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 BRAPQ7Z569 592 aa23.06■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 ZNF446Q9NWS9 450 aa23.06■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.05■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 KIF28PB7ZC32 967 aa23.05■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 TPM4P67936 248 aa23.05■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.05■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 LRRN4CLQ8ND94 238 aa23.05■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.05■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.05■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.05■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 FOXP2O15409 715 aa23.05■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa23.05■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.05■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 C4AP0C0L4 1744 aa23.04■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 C4BP0C0L5 1744 aa23.04■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 EYA2O00167 538 aa23.04■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.04■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 PRC1O43663 620 aa23.04■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 PFKFB1P16118 471 aa23.04■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 CCDC93Q567U6 631 aa23.04■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 DCAF5Q96JK2 942 aa23.04■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 CYP27B1O15528 508 aa23.03■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 ANO1Q5XXA6 986 aa23.03■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.03■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.282e-9■■□□□ 13.2
ILF3-217ENST00000589998 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 NRDCO43847 1150 aa23.02■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 FANCCQ00597 558 aa23.02■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.02■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 TMEM94Q12767 1356 aa23.02■■□□□ 1.28
ILF3-217ENST00000589998 CMA1P23946 247 aa23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 138.5 ms