RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582955.5

SMARCE1-218, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-218ENST00000582955 LPIN2Q92539 896 aa15.64■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 MYOZ2Q9NPC6 264 aa15.64■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 SASH1O94885 1247 aa15.63■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 BCAMP50895 628 aa15.63■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 ATP8B2P98198 1209 aa15.63■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 FBXO33Q7Z6M2 555 aa15.63■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 PGAP2Q9UHJ9 254 aa15.63■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 HDAC9Q9UKV0 1011 aa15.63■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 DDX19BQ9UMR2 479 aa15.63■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 F8W031 263 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 TRAF5O00463 557 aa15.62■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 CERS5Q8N5B7 392 aa15.62■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 CEP350Q5VT06 3117 aa15.61■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 TFCP2Q12800 502 aa15.61■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 SCARF1Q14162 830 aa15.61■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 CDC37L1Q7L3B6 337 aa15.61■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 CREBZFQ9NS37 354 aa15.61■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 GGA3Q9NZ52 723 aa15.61■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 FAM205AQ6ZU69 1335 aa15.61■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 TMEM88BA6NKF7 163 aa15.6■□□□□ 0.09
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SMARCE1-218ENST00000582955 POLA2Q14181 598 aa15.6■□□□□ 0.09
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SMARCE1-218ENST00000582955 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.6■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 CEP85Q6P2H3 762 aa15.6■□□□□ 0.09
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SMARCE1-218ENST00000582955 SSH3Q8TE77 659 aa15.6■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 AKAP2Q9Y2D5 859 aa15.6■□□□□ 0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
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SMARCE1-218ENST00000582955 A0A1B0GUL7 405 aa15.58■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 ADM5C9JUS6 153 aa15.58■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 ADORA1P30542 326 aa15.58■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 TIMM10P62072 90 aa15.58■□□□□ 0.08
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SMARCE1-218ENST00000582955 SULF1Q8IWU6 871 aa15.58■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 WNT10BO00744 389 aa15.57■□□□□ 0.08
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SMARCE1-218ENST00000582955 PHKA1P46020 1223 aa15.57■□□□□ 0.08
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SMARCE1-218ENST00000582955 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa15.57■□□□□ 0.08
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SMARCE1-218ENST00000582955 NEUROD6Q96NK8 337 aa15.57■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa15.57■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 CFAP100Q494V2 611 aa15.56■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 DLK2Q6UY11 383 aa15.56■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 KLRG1Q96E93 195 aa15.56■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 ARAP2Q8WZ64 1704 aa15.56■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 TRPM7Q96QT4 1865 aa15.56■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 MYH13Q9UKX3 1938 aa15.55■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa15.55■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 RRP1P56182 461 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 GORABQ5T7V8 394 aa15.55■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 CST9Q5W186 159 aa15.55■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 CCDC102BQ68D86 513 aa15.55■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 XAGE2Q96GT9 111 aa15.55■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa15.55■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 HMMRO75330 724 aa15.54■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 GRIK5Q16478 980 aa15.54■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 MTMR14Q8NCE2 650 aa15.54■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 WDR66Q8TBY9 1149 aa15.54■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 DENND2AQ9ULE3 1009 aa15.54■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa15.54■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.53■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 SEMA3EO15041 775 aa15.53■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 MYO1BO43795 1136 aa15.53■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 SPDYE6P0CI01 402 aa15.53■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 CDCA5Q96FF9 252 aa15.53■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 SERPINA10Q9UK55 444 aa15.53■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 CNTNAP1P78357 1384 aa15.52■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 MAST3O60307 1309 aa15.52■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 CLRN2A0PK11 232 aa15.52■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 CRKP46108 304 aa15.52■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 TNNI3KQ59H18 835 aa15.52■□□□□ 0.08
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