RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 BICDL2A1A5D9 508 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 GNAT2P19087 354 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 PICALMQ13492 652 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 MCM7P33993 719 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 LINS1Q8NG48 757 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 KRT24Q2M2I5 525 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC121Q6ZUS5 278 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 OTUD6BQ8N6M0 293 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 VPS18Q9P253 973 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 PTPRKQ15262 1439 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 F8W031 263 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 FERP16591 822 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 MSH6P52701 1360 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 CALML3P27482 149 aa24.14■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 GBP6Q6ZN66 633 aa24.14■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 NBPF11Q86T75 865 aa24.14■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 ATP6V1AP38606 617 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 NEK11Q8NG66 645 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 RAD50Q92878 1312 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 RHOXF2BP0C7M4 288 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 RXRAP19793 462 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 RHOXF2Q9BQY4 288 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 PHACTR2O75167 634 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB9Q96C00 473 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 KRT79Q5XKE5 535 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 SELENOSQ9BQE4 189 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC77Q9BR77 488 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 DAAM2Q86T65 1068 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 SETDB2Q96T68 719 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1B0GUL7 405 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINA10Q9UK55 444 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 GJC1P36383 396 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 TNRQ92752 1358 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 GSTA5Q7RTV2 222 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 MAP3K5Q99683 1374 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC160A6NGH7 325 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 TUBB4BP68371 445 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 TRAF1Q13077 416 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 PIK3C2GO75747 1445 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 CPA1P15085 419 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 MXRA7P84157 204 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 ANKS4BQ8N8V4 417 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1B0GVL5 298 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 TERF1P54274 439 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 IFT81Q8WYA0 676 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 PSMD1Q99460 953 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 PLIN2Q99541 437 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 NLRP3Q96P20 1036 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 ELP1O95163 1332 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 CLGNO14967 610 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 CEP83Q9Y592 693 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 FLT4P35916 1363 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 TNNI2P48788 182 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 FAM13AO94988 1023 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 DTHD1Q6ZMT9 781 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 RBSNQ9H1K0 784 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 MCM9Q9NXL9 1143 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.08■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 MYL5Q02045 173 aa24.08■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 ATL3Q6DD88 541 aa24.08■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC114Q96M63 670 aa24.08■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.08■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 RPS6KB1P23443 525 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
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