RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 COL19A1Q14993 1142 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRM-204ENST00000577468 FBLN7Q53RD9 439 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRM-204ENST00000577468 NUTM2GQ5VZR2 741 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRM-204ENST00000577468 C16orf46Q6P387 395 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRM-204ENST00000577468 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRM-204ENST00000577468 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRM-204ENST00000577468 SUGCTQ9HAC7 445 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRM-204ENST00000577468 CYP4F12Q9HCS2 524 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRM-204ENST00000577468 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRM-204ENST00000577468 C19orf57Q0VDD7 668 aa4.55□□□□□ -1.68
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PTPRM-204ENST00000577468 TIAF1O95411 115 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRM-204ENST00000577468 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRM-204ENST00000577468 USP11P51784 963 aa4.54□□□□□ -1.68
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PTPRM-204ENST00000577468 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
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PTPRM-204ENST00000577468 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRM-204ENST00000577468 KSR1Q8IVT5 923 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 GATA6Q92908 595 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM63CQ9P1W3 806 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 CNTN3Q9P232 1028 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 KANSL3Q9P2N6 904 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
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