RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 CASZ1Q86V15 1759 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 LAMA4Q16363 1823 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 CHGBP05060 677 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 SERPINB2P05120 415 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 M0R2C6 588 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 STX6O43752 255 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 MMP10P09238 476 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 FGFR2P21802 821 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 SCARF1Q14162 830 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 WASHC4Q2M389 1173 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 MBD3O95983 291 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 GJB2P29033 226 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 MCAMP43121 646 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 PDCP20941 246 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 SYT1P21579 422 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC102BQ68D86 513 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 OSBP2Q969R2 916 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 CNBD1Q8NA66 436 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 DOCK2Q92608 1830 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 MRE11P49959 708 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 A0A1B0GUL6 1792 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 F13A1P00488 732 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 ADD2P35612 726 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 PHKA1P46020 1223 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 FGD1P98174 961 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 ST3GAL1Q11201 340 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 UBE3CQ15386 1083 aa22.16■■□□□ 1.14
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SPNS3-204ENST00000575194 Q6ZUG5 572 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 NECAB1Q8N987 351 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 PI16Q6UXB8 463 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 E7EWF7 191 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 ZBTB7AO95365 584 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS3-204ENST00000575194 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.14■■□□□ 1.14
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SPNS3-204ENST00000575194 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.14■■□□□ 1.13
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SPNS3-204ENST00000575194 GTF3C6Q969F1 213 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 NPHP1O15259 732 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 GPAA1O43292 621 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 SPATA5Q8NB90 893 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 ST5P78524 1137 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 NLRP3Q96P20 1036 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 MTMR6Q9Y217 621 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.11■■□□□ 1.13
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SPNS3-204ENST00000575194 ZNF445P59923 1031 aa22.11■■□□□ 1.13
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SPNS3-204ENST00000575194 MAP3K12Q12852 859 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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SPNS3-204ENST00000575194 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 FBXL16Q8N461 479 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 BRF1Q92994 677 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 SOCS7O14512 581 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 PFKFB2O60825 505 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS3-204ENST00000575194 STK3Q13188 491 aa22.09■■□□□ 1.13
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