RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566243.5

EDC3-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 3, humanhuman

TSL 3

Gene EDC3, Length 711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3-211ENST00000566243 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
EDC3-211ENST00000566243 MS4A1P11836 297 aa23.7■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 SLC5A1P13866 664 aa23.7■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 ATP2B3Q16720 1220 aa23.7■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.7■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 USP48Q86UV5 1035 aa23.7■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 KLRG1Q96E93 195 aa23.7■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 GGA3Q9NZ52 723 aa23.7■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 ATP8B2P98198 1209 aa23.69■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 POLA2Q14181 598 aa23.69■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 CST9Q5W186 159 aa23.69■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.68■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.68■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 COG6Q9Y2V7 657 aa23.68■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 ADM5C9JUS6 153 aa23.67■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 F8W031 263 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 TFCP2Q12800 502 aa23.67■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.67■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 SSH3Q8TE77 659 aa23.67■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.67■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 WNT10BO00744 389 aa23.66■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 MMP14P50281 582 aa23.66■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.66■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 CELF2O95319 508 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 ADORA1P30542 326 aa23.65■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 CEP85Q6P2H3 762 aa23.65■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.65■■□□□ 1.38
EDC3-211ENST00000566243 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 TIMM10P62072 90 aa23.64■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 GRIK5Q16478 980 aa23.64■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 SULF1Q8IWU6 871 aa23.63■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.63■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.63■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 A0A1B0GUL7 405 aa23.62■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 PHKA1P46020 1223 aa23.62■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.62■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 CNTNAP1P78357 1384 aa23.62■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.61■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 PDE3AQ14432 1141 aa23.61■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 DLGAP5Q15398 846 aa23.61■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 CFAP100Q494V2 611 aa23.61■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.61■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 AOX1Q06278 1338 aa23.6■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 RASSF10A6NK89 507 aa23.6■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 JMYQ8N9B5 988 aa23.6■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.6■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.6■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 CCDC102BQ68D86 513 aa23.59■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 CDCA5Q96FF9 252 aa23.59■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 XAGE2Q96GT9 111 aa23.59■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.59■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.58■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 SPDYE6P0CI01 402 aa23.58■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
EDC3-211ENST00000566243 VEGFBP49765 207 aa23.57■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.57■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.57■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.57■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.57■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.56■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.56■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 PCNTO95613 3336 aa23.56■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 CLRN2A0PK11 232 aa23.55■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 SEMA3EO15041 775 aa23.55■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 ZBTB22O15209 634 aa23.55■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 CRKP46108 304 aa23.55■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.55■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 RASGRF1Q13972 1273 aa23.54■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 TNNI3KQ59H18 835 aa23.54■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 GPR108Q9NPR9 543 aa23.54■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.54■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.54■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.54■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.53■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 CYP4F22Q6NT55 531 aa23.52■■□□□ 1.36
EDC3-211ENST00000566243 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
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