RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa27.42■■□□□ 1.98
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OGFOD1Q8N543 542 aa27.42■■□□□ 1.98
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CERS5Q8N5B7 392 aa27.41■■□□□ 1.98
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYH13Q9UKX3 1938 aa27.41■■□□□ 1.98
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A1B0GUL7 405 aa27.4■■□□□ 1.98
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PGAP2Q9UHJ9 254 aa27.4■■□□□ 1.98
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HDAC9Q9UKV0 1011 aa27.4■■□□□ 1.98
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EGFRP00533 1210 aa27.39■■□□□ 1.98
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MFSD14BQ5SR56 506 aa27.39■■□□□ 1.98
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIAA0825Q8IV33 1275 aa27.39■■□□□ 1.98
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CNTROBQ8N137 903 aa27.39■■□□□ 1.98
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZBTB22O15209 634 aa27.37■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADORA1P30542 326 aa27.37■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TIMM10P62072 90 aa27.37■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa27.37■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PASKQ96RG2 1323 aa27.37■■□□□ 1.97
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 APLP1P51693 650 aa27.36■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERC1Q8IUD2 1116 aa27.36■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SIRT2Q8IXJ6 389 aa27.36■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 XAGE2Q96GT9 111 aa27.36■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PHKA1P46020 1223 aa27.35■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC102BQ68D86 513 aa27.35■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NEUROD6Q96NK8 337 aa27.35■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa27.35■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNNI3KQ59H18 835 aa27.34■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa27.34■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WDR66Q8TBY9 1149 aa27.33■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GGA3Q9NZ52 723 aa27.33■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DENND2AQ9ULE3 1009 aa27.33■■□□□ 1.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 F8W031 263 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCARF1Q14162 830 aa27.31■■□□□ 1.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GORABQ5T7V8 394 aa27.31■■□□□ 1.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDC37L1Q7L3B6 337 aa27.31■■□□□ 1.96
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa27.31■■□□□ 1.96
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAST3O60307 1309 aa27.28■■□□□ 1.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SALL1Q9NSC2 1324 aa27.28■■□□□ 1.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAB11FIP3O75154 756 aa27.28■■□□□ 1.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RASGRF1Q13972 1273 aa27.28■■□□□ 1.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NBPF9Q3BBW0 867 aa27.28■■□□□ 1.96
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KRT26Q7Z3Y9 468 aa27.28■■□□□ 1.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIF1BPQ96EK5 621 aa27.28■■□□□ 1.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ECM29Q5VYK3 1845 aa27.27■■□□□ 1.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CFAP100Q494V2 611 aa27.27■■□□□ 1.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SULF1Q8IWU6 871 aa27.27■■□□□ 1.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RHPN1Q8TCX5 695 aa27.27■■□□□ 1.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SERPINA10Q9UK55 444 aa27.27■■□□□ 1.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRPM7Q96QT4 1865 aa27.27■■□□□ 1.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRAF5O00463 557 aa27.26■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa27.26■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DBNDD2Q9BQY9 259 aa27.26■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CREBZFQ9NS37 354 aa27.26■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GRIK5Q16478 980 aa27.25■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPDYE2BA6NHP3 402 aa27.24■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM88BA6NKF7 163 aa27.24■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPDYE6P0CI01 402 aa27.24■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AAMPQ13685 434 aa27.24■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC158Q5M9N0 1113 aa27.24■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 USP48Q86UV5 1035 aa27.24■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADM5C9JUS6 153 aa27.23■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYO1BO43795 1136 aa27.23■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CRKP46108 304 aa27.23■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP27.23■■□□□ 1.953e-6■□□□□ 9.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TTC39AQ5SRH9 613 aa27.23■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AACSQ86V21 672 aa27.23■■□□□ 1.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.95
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