RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

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Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RBSNQ9H1K0 784 aa25.19■■□□□ 1.62
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.18■■□□□ 1.62
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.14■■□□□ 1.61
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.13■■□□□ 1.61
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GNAT2P19087 354 aa25.07■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BCAMP50895 628 aa25.07■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UBE4AQ14139 1066 aa25.06■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATL3Q6DD88 541 aa25.06■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BTAF1O14981 1849 aa25.06■■□□□ 1.6
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANTXR2P58335 489 aa25.05■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.05■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SNAP23O00161 211 aa25.05■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MBD4O95243 580 aa25.05■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UVSSAQ2YD98 709 aa25.05■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.04■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GOLGA8BA8MQT2 603 aa25.04■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZPR1O75312 459 aa25.04■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.04■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDLIM2Q96JY6 352 aa25.04■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SETDB2Q96T68 719 aa25.04■■□□□ 1.6
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