RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 PHF24Q9UPV7 400 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 PIK3C2AO00443 1686 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 A6NJY4 79 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 USP17L5A8MUK1 530 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 LBX1P52954 281 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 RASSF7Q02833 373 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 SMIM5Q71RC9 77 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 ACDQ96AP0 544 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 AIDAQ96BJ3 306 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 USP6P35125 1406 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 ANKARQ7Z5J8 1434 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 EXOC5O00471 708 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 CDK2AP1O14519 115 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 BCRP11274 1271 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 MAP2K3P46734 347 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 MTFR1Q15390 333 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 CABP1Q9NZU7 370 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 COL18A1P39060 1754 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 BACH1O14867 736 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 GDF11O95390 407 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 IRS1P35568 1242 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 RGL3Q3MIN7 710 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 NEDD1Q8NHV4 660 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 USP3Q9Y6I4 520 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 CPDO75976 1380 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 SBF1O95248 1867 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 LY75O60449 1722 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 GCP02774 474 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 ATP4AP20648 1035 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 ABTB2Q8N961 1025 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 POGKQ9P215 609 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 ITSN1Q15811 1721 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 BNIP3LO60238 219 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 NBPF1Q3BBV0 1214 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 UCN2Q96RP3 112 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF358Q9NW07 568 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 BCS1LQ9Y276 419 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 USP17L3A6NCW0 530 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 USP17L4A6NCW7 530 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 OIP5O43482 229 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 BMP4P12644 408 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 TATP17735 454 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 FGFR3P22607 806 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 KANK3Q6NY19 840 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 NLRP8Q86W28 1048 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 TRIM50Q86XT4 487 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 USP54Q70EL1 1684 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 QRICH2Q9H0J4 1663 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1W2PNR3 127 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 C2CD2LO14523 706 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 ATP9BO43861 1147 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 ITGAEP38570 1179 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 ATP1A2P50993 1020 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 CTBSQ01459 385 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms