RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 VPS37DQ86XT2 251 aa21.34■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CPA1P15085 419 aa21.34■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ALDH1B1P30837 517 aa21.34■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPSM2P81274 684 aa21.34■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 APPBP2Q92624 585 aa21.34■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 MASTLQ96GX5 879 aa21.34■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.34■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.33■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADD2P35612 726 aa21.33■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.33■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF20Q5VTR2 975 aa21.33■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SP8Q8IXZ3 490 aa21.33■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.33■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBE3CQ15386 1083 aa21.32■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.32■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 DOCK2Q92608 1830 aa21.32■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP2B4P23634 1241 aa21.32■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 MCM2P49736 904 aa21.32■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.32■■□□□ 1
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USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.32■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAP3K12Q12852 859 aa21.31■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.31■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 STYK1Q6J9G0 422 aa21.3■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.3■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 IL27Q8NEV9 243 aa21.3■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMX3Q96JJ7 454 aa21.3■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.3■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.3■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.3■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 GGA1Q9UJY5 639 aa21.3■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.3■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDE6AP16499 860 aa21.29■■□□□ 1
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USP3-AS1-208ENST00000560962 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.29■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 LTBP1Q14766 1721 aa21.29■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.29■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 H0YIN7 160 aa21.29■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 UFL1O94874 794 aa21.29■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDIT3P35638 169 aa21.29■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.28■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.28■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPAA1O43292 621 aa21.27■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYP21A2P08686 494 aa21.27■■□□□ 1
USP3-AS1-208ENST00000560962 AK2P54819 239 aa21.27■■□□□ 1
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USP3-AS1-208ENST00000560962 PSMA5P28066 241 aa21.27■□□□□ 0.99
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USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.27■□□□□ 0.99
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.27■□□□□ 0.99
USP3-AS1-208ENST00000560962 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.27■□□□□ 0.99
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USP3-AS1-208ENST00000560962 CNKSR1Q969H4 720 aa21.24■□□□□ 0.99
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USP3-AS1-208ENST00000560962 CHRNA5P30532 468 aa21.23■□□□□ 0.99
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USP3-AS1-208ENST00000560962 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.22■□□□□ 0.99
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USP3-AS1-208ENST00000560962 CD209Q9NNX6 404 aa21.22■□□□□ 0.99
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