RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	FRMD6	Q96NE9	622 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934		A0A096LPE4	126 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PPZ6	126 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	GIPC1	O14908	333 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	ABCB6	Q9NP58	842 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	SOGA1	O94964	1423 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	USP17L7	P0C7H9	530 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	PTPRA	P18433	802 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	CDC27	P30260	824 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	MUC3B	Q9H195	1237 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	TOP2B	Q02880	1626 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	BAG6	P46379	1132 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	DGKG	P49619	791 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	BSND	Q8WZ55	320 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	ADAM19	Q9H013	955 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	LINC01387	J3KSC0	135 aa		7.1	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	CTSH	P09668	335 aa		7.1	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	EPHA1	P21709	976 aa		7.1	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	MSL1	Q68DK7	614 aa		7.1	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		7.1	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	BCL11A	Q9H165	835 aa		7.1	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	SOX13	Q9UN79	622 aa		7.1	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		7.1	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	WDR62	O43379	1518 aa		7.1	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		7.1	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		7.09	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	FAM177B	A6PVY3	158 aa		7.09	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	NID1	P14543	1247 aa		7.09	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	GSTT1	P30711	240 aa		7.09	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		7.09	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		7.09	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		7.09	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		7.09	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		7.09	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	BACH2	Q9BYV9	841 aa		7.09	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		7.09	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		7.09	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	PPME1	Q9Y570	386 aa		7.09	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	CUX2	O14529	1486 aa		7.09	□□□□□ -1.27
LINS1-210	ENST00000560934	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		7.09	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934		E9PSI1	815 aa		7.08	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	ITPKA	P23677	461 aa		7.08	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		7.08	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		7.08	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM11	Q96F44	468 aa		7.08	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF576	Q9H609	170 aa		7.08	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	FBXO24	O75426	580 aa		7.07	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	CABP4	P57796	275 aa		7.07	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	FAAP100	Q0VG06	881 aa		7.07	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		7.07	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		7.07	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		7.07	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		7.07	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	PLVAP	Q9BX97	442 aa		7.07	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	RECK	O95980	971 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	PCDH1	Q08174	1060 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	IKBKE	Q14164	716 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	ILDR2	Q71H61	639 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	7.05	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	FAM229A	H3BQW9	127 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934		H3BRJ5	948 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	VAMP1	P23763	118 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	ITGAE	P38570	1179 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
LINS1-210	ENST00000560934	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28

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