RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560163.1

RABGGTA-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-214ENST00000560163 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.4■■□□□ 1.66
RABGGTA-214ENST00000560163 GJA5P36382 358 aa25.39■■□□□ 1.66
RABGGTA-214ENST00000560163 CASP7P55210 303 aa25.39■■□□□ 1.66
RABGGTA-214ENST00000560163 CAP1Q01518 475 aa25.39■■□□□ 1.66
RABGGTA-214ENST00000560163 ARMC5Q96C12 935 aa25.39■■□□□ 1.66
RABGGTA-214ENST00000560163 ERO1AQ96HE7 468 aa25.39■■□□□ 1.66
RABGGTA-214ENST00000560163 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 CHRNDQ07001 517 aa25.38■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 CRHR2Q13324 411 aa25.38■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 PTPN18Q99952 460 aa25.38■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 G2E3Q7L622 706 aa25.37■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.37■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.37■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 AOX1Q06278 1338 aa25.37■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.36■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 SNAP23O00161 211 aa25.36■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 SPDYE6P0CI01 402 aa25.36■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 EN2P19622 333 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 GCKRQ14397 625 aa25.36■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.36■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 IL1R1P14778 569 aa25.34■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 CFAP100Q494V2 611 aa25.34■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.34■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 EFCC1Q9HA90 598 aa25.34■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 CLRN2A0PK11 232 aa25.33■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 KCNJ4P48050 445 aa25.33■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 SP3Q02447 781 aa25.33■■□□□ 1.65
RABGGTA-214ENST00000560163 MYO1BO43795 1136 aa25.32■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 TAF5LO75529 589 aa25.32■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.32■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 STK31Q9BXU1 1019 aa25.32■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 RASA3Q14644 834 aa25.31■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.31■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 A0A1B0GUL6 1792 aa25.31■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 F8W031 263 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 SLC4A2P04920 1241 aa25.3■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 ZNF333Q96JL9 665 aa25.29■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 VEZTQ9HBM0 779 aa25.29■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 OTOFQ9HC10 1997 aa25.29■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 SZT2Q5T011 3432 aa25.28■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.28■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 FOXO4P98177 505 aa25.27■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.27■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 LINS1Q8NG48 757 aa25.27■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 OPTNQ96CV9 577 aa25.27■■□□□ 1.64
RABGGTA-214ENST00000560163 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
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RABGGTA-214ENST00000560163 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.26■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 ELP3Q9H9T3 547 aa25.26■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 FLIIQ13045 1269 aa25.25■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.25■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.25■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 TMEM106CQ9BVX2 250 aa25.25■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 JAG2Q9Y219 1238 aa25.25■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.24■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.24■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 TNFAIP1Q13829 316 aa25.22■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.22■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 NBPF11Q86T75 865 aa25.21■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
RABGGTA-214ENST00000560163 GTF2A2P52657 109 aa25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 ARHGEF6Q15052 776 aa25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 CCDC27Q2M243 656 aa25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 CEP290O15078 2479 aa25.19■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.19■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 VGLL4Q14135 290 aa25.19■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 CCL15Q16663 113 aa25.19■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 MAP3K9P80192 1104 aa25.18■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.18■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.18■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 WWC1Q8IX03 1113 aa25.18■■□□□ 1.62
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