RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-201ENST00000558831 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM227BQ96M60 508 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-201ENST00000558831 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL25Q9H293 177 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-201ENST00000558831 BCS1LQ9Y276 419 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-201ENST00000558831 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-201ENST00000558831 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-201ENST00000558831 WASHC4Q2M389 1173 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP26Q9BXU7 913 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A0D9SFI3 127 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-201ENST00000558831 SEMA3EO15041 775 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-201ENST00000558831 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.77■□□□□ 0.92
USP3-AS1-201ENST00000558831 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.77■□□□□ 0.92
USP3-AS1-201ENST00000558831 SNED1Q8TER0 1413 aa20.77■□□□□ 0.92
USP3-AS1-201ENST00000558831 RIMBP2O15034 1052 aa20.77■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHGBP05060 677 aa20.77■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 PSMD1Q99460 953 aa20.77■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 SYT17Q9BSW7 474 aa20.77■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 G3V3G9 751 aa20.76■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.76■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.76■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 TICAM2Q86XR7 235 aa20.76■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAD50Q92878 1312 aa20.76■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZBTB22O15209 634 aa20.75■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 COA1Q9GZY4 146 aa20.75■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.75■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.74■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.74■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 CD209Q9NNX6 404 aa20.74■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.74■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.74■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCF2Q9UG63 623 aa20.74■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.73■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL1R1P14778 569 aa20.73■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 MCCP23508 829 aa20.73■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAP3K12Q12852 859 aa20.73■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.73■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.73■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYH7P12883 1935 aa20.73■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPIP5K2O43314 1243 aa20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 VPS33BQ9H267 617 aa20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 AOC3Q16853 763 aa20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 DOK7Q18PE1 504 aa20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-201ENST00000558831 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADD2P35612 726 aa20.7■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTH1RQ03431 593 aa20.7■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 PODNQ7Z5L7 613 aa20.7■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.7■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 APPBP2Q92624 585 aa20.7■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAI14Q9P0K7 980 aa20.7■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 JAG2Q9Y219 1238 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 DOCK2Q92608 1830 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDE6AP16499 860 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 OSBP2Q969R2 916 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAST3O60307 1309 aa20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 M0R2C6 588 aa20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBE3CQ15386 1083 aa20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 ECE2O60344 883 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 NFKBIEO00221 500 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAP4K1Q92918 833 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHD4Q14839 1912 aa20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 HSPA4P34932 840 aa20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 GTF2IP78347 998 aa20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms