RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558771.1

LRRC28-208, Transcript of leucine rich repeat containing 28, human

TSL 4

Gene LRRC28, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC28-208	ENST00000558771	HMOX1	P09601	288 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	EPHX2	P34913	555 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	ST5	P78524	1137 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	NR6A1	Q15406	480 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	CCDC93	Q567U6	631 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	SOGA3	Q5TF21	947 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	CNTROB	Q8N137	903 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	CNBD1	Q8NA66	436 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	SETDB2	Q96T68	719 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	HACL1	Q9UJ83	578 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	CAMTA2	O94983	1202 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	ALDH1A1	P00352	501 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	AVP	P01185	164 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	USP17L8	P0C7I0	530 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	RGS19	P49795	217 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	A1BG	P04217	495 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	AGER	Q15109	404 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	ZNF790	Q6PG37	636 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	OLFM4	Q6UX06	510 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	FZD9	O00144	591 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	NPR1	P16066	1061 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	MPND	Q8N594	471 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	CAPNS2	Q96L46	248 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	AAAS	Q9NRG9	546 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	ST8SIA5	O15466	376 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	TEF	Q10587	303 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	GRM1	Q13255	1194 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	GPC2	Q8N158	579 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	SYNE4	Q8N205	404 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	HPS1	Q92902	700 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	LTBP1	Q14766	1721 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	KCNQ3	O43525	872 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	ECE1	P42892	770 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	SNED1	Q8TER0	1413 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LRRC28-208	ENST00000558771	COL4A5	P29400	1685 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LRRC28-208	ENST00000558771	FAM177B	A6PVY3	158 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LRRC28-208	ENST00000558771	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LRRC28-208	ENST00000558771	AXIN1	O15169	862 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LRRC28-208	ENST00000558771	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
LRRC28-208	ENST00000558771	AOC2	O75106	756 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LRRC28-208	ENST00000558771	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
LRRC28-208	ENST00000558771	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
LRRC28-208	ENST00000558771	ALDH1B1	P30837	517 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LRRC28-208	ENST00000558771	EPS15	P42566	896 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LRRC28-208	ENST00000558771	SCNN1D	P51172	638 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LRRC28-208	ENST00000558771	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
LRRC28-208	ENST00000558771	CST9	Q5W186	159 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LRRC28-208	ENST00000558771	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		7.33	□□□□□ -1.24

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