RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 TICAM2Q86XR7 235 aa28.91■■■□□ 2.22
MEIS3-204ENST00000558555 SUPT20HQ8NEM7 779 aa28.91■■■□□ 2.22
MEIS3-204ENST00000558555 RFX7Q2KHR2 1363 aa28.9■■■□□ 2.22
MEIS3-204ENST00000558555 ZBTB22O15209 634 aa28.89■■■□□ 2.22
MEIS3-204ENST00000558555 WASHC4Q2M389 1173 aa28.89■■■□□ 2.22
MEIS3-204ENST00000558555 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
MEIS3-204ENST00000558555 ANTXR1Q9H6X2 564 aa28.89■■■□□ 2.22
MEIS3-204ENST00000558555 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 BCS1LQ9Y276 419 aa28.89■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 RIMBP2O15034 1052 aa28.88■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 RUFY2Q8WXA3 655 aa28.88■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 MYH7P12883 1935 aa28.86■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 G3V3G9 751 aa28.86■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 DCAF8Q5TAQ9 597 aa28.86■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 CD209Q9NNX6 404 aa28.86■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 SNED1Q8TER0 1413 aa28.86■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 COA1Q9GZY4 146 aa28.86■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 IL1R1P14778 569 aa28.84■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa28.84■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 PSMD1Q99460 953 aa28.84■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa28.84■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 DOCK2Q92608 1830 aa28.83■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 IDH1O75874 414 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 SEC24BO95487 1268 aa28.83■■■□□ 2.21
MEIS3-204ENST00000558555 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 MAP3K12Q12852 859 aa28.82■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 LRP2BPQ9P2M1 347 aa28.82■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 WDR66Q8TBY9 1149 aa28.81■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 REC8O95072 547 aa28.8■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 ABCF2Q9UG63 623 aa28.8■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa28.8■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 RAD50Q92878 1312 aa28.79■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 KIAA2012Q0VF49 1180 aa28.79■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 DOK7Q18PE1 504 aa28.79■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 FAM227BQ96M60 508 aa28.79■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 SGSM2O43147 1006 aa28.78■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 PPIP5K2O43314 1243 aa28.78■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa28.78■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 VPS33BQ9H267 617 aa28.78■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa28.78■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 AOC3Q16853 763 aa28.77■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.77■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 SALL1Q9NSC2 1324 aa28.77■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 A0A0D9SFI3 127 aa28.77■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 PODNQ7Z5L7 613 aa28.77■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 HELLSQ9NRZ9 838 aa28.77■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 RAI14Q9P0K7 980 aa28.77■■■□□ 2.2
MEIS3-204ENST00000558555 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa28.76■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.76■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 JAG2Q9Y219 1238 aa28.76■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 PDE6AP16499 860 aa28.75■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 ADD2P35612 726 aa28.75■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa28.75■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa28.75■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.75■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 DBNDD1Q9H9R9 158 aa28.75■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 FAM205AQ6ZU69 1335 aa28.75■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 UBE3CQ15386 1083 aa28.74■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa28.74■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 APPBP2Q92624 585 aa28.74■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa28.74■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 ECE2O60344 883 aa28.74■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 IGSF3O75054 1194 aa28.74■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa28.74■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 MAGEB6Q8N7X4 407 aa28.74■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 ANO2Q9NQ90 1003 aa28.74■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 GTF2IP78347 998 aa28.73■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 LARGE2Q8N3Y3 721 aa28.73■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 FBXW7Q969H0 707 aa28.73■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 CHGBP05060 677 aa28.72■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF532Q9HCE3 1301 aa28.72■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 LDHBP07195 334 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 IL25Q9H293 177 aa28.72■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 SLFNL1Q499Z3 407 aa28.71■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 TTLL5Q6EMB2 1281 aa28.71■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 MAST2Q6P0Q8 1798 aa28.71■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 IARSP41252 1262 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 MFSD14BQ5SR56 506 aa28.7■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
MEIS3-204ENST00000558555 PRDX5P30044 214 aa28.69■■■□□ 2.18
MEIS3-204ENST00000558555 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
MEIS3-204ENST00000558555 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
MEIS3-204ENST00000558555 OSBP2Q969R2 916 aa28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms