RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553786.1

PRRX1-208, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PRRX1, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-208ENST00000553786 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.39■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.39■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.39■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 IL16Q14005 1332 aa21.38■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.38■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 CLRN2A0PK11 232 aa21.38■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 MYO1BO43795 1136 aa21.38■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 INHBEP58166 350 aa21.38■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 IFNL1Q8IU54 200 aa21.38■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.38■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.38■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 MAP3K11Q16584 847 aa21.37■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 CFAP100Q494V2 611 aa21.37■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 WNK4Q96J92 1243 aa21.37■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 VEZTQ9HBM0 779 aa21.37■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.36■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 SPDYE6P0CI01 402 aa21.36■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 TRIM17Q9Y577 477 aa21.36■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.35■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 IL1R1P14778 569 aa21.35■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.35■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 JAG2Q9Y219 1238 aa21.35■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 FOXO4P98177 505 aa21.34■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 CCDC184Q52MB2 194 aa21.34■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 HTTP42858 3142 aa21.33■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 UNCXA6NJT0 531 aa21.33■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.33■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 AOX1Q06278 1338 aa21.32■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 F6X3S4 739 aa21.32■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.32■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.32■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 A0A1B0GUL6 1792 aa21.31■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 PLIN1O60240 522 aa21.31■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 RASA3Q14644 834 aa21.31■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.31■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.31■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 ERO1AQ96HE7 468 aa21.31■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.31■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 CRHR2Q13324 411 aa21.3■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.3■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 BEND3Q5T5X7 828 aa21.3■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.3■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.3■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 VAMP4O75379 141 aa21.29■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 GJA5P36382 358 aa21.29■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 TNFAIP1Q13829 316 aa21.29■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.29■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 GRM8O00222 908 aa21.28■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.28■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.28■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 LAMB1P07942 1786 aa21.28■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 POTEFA5A3E0 1075 aa21.27■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.27■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 GCC1Q96CN9 775 aa21.27■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 ELP3Q9H9T3 547 aa21.27■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.27■■□□□ 1
PRRX1-208ENST00000553786 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.27■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 OPTNQ96CV9 577 aa21.26■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 EFCC1Q9HA90 598 aa21.26■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 WDR63Q8IWG1 891 aa21.25■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 PTPN18Q99952 460 aa21.25■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.25■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 GYG1P46976 350 aa21.24■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 SP3Q02447 781 aa21.24■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 CACNA1FO60840 1977 aa21.24■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 OTOFQ9HC10 1997 aa21.23■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 UBE4AQ14139 1066 aa21.23■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.23■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 MRS2Q9HD23 443 aa21.23■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.22■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 ARMC5Q96C12 935 aa21.22■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 ALDH1L1O75891 902 aa21.21■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 TNNI2P48788 182 aa21.21■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.21■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
PRRX1-208ENST00000553786 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms