RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	SCARF1	Q14162	830 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	POLA2	Q14181	598 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	USP48	Q86UV5	1035 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	LPIN2	Q92539	896 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	CREBZF	Q9NS37	354 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	GGA3	Q9NZ52	723 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	COG6	Q9Y2V7	657 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985		F8W031	263 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	TFCP2	Q12800	502 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	CST9	Q5W186	159 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	VPS37D	Q86XT2	251 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	OGFOD1	Q8N543	542 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	ADM5	C9JUS6	153 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	MS4A1	P11836	297 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	ADORA1	P30542	326 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	GRIK5	Q16478	980 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	SSH3	Q8TE77	659 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	KLRG1	Q96E93	195 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TPCN1-223	ENST00000552985	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	WNT10B	O00744	389 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	TIMM10	P62072	90 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	CEP85	Q6P2H3	762 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	AOX1	Q06278	1338 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	PHKA1	P46020	1223 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	13.94	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	PDE3A	Q14432	1141 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	CNTNAP1	P78357	1384 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A1B0GUL7	405 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	MMP14	P50281	582 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	DLGAP5	Q15398	846 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	SULF1	Q8IWU6	871 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	XAGE2	Q96GT9	111 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	SPDYE6	P0CI01	402 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC102B	Q68D86	513 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	CDCA5	Q96FF9	252 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	PCNT	O95613	3336 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	RASSF10	A6NK89	507 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	VEGFB	P49765	207 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	JMY	Q8N9B5	988 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TPCN1-223	ENST00000552985	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TPCN1-223	ENST00000552985	CRK	P46108	304 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TPCN1-223	ENST00000552985	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
TPCN1-223	ENST00000552985	RASGRF1	Q13972	1273 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TPCN1-223	ENST00000552985	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TPCN1-223	ENST00000552985	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TPCN1-223	ENST00000552985	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TPCN1-223	ENST00000552985	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TPCN1-223	ENST00000552985	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TPCN1-223	ENST00000552985	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TPCN1-223	ENST00000552985	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TPCN1-223	ENST00000552985	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TPCN1-223	ENST00000552985	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TPCN1-223	ENST00000552985	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TPCN1-223	ENST00000552985	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TPCN1-223	ENST00000552985	SEMA3E	O15041	775 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TPCN1-223	ENST00000552985	PRDX5	P30044	214 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TPCN1-223	ENST00000552985	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TPCN1-223	ENST00000552985	PI16	Q6UXB8	463 aa		13.87	□□□□□ -0.19

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