RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 UNC80Q8N2C7 3258 aa8.82□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 CEP290O15078 2479 aa8.81□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 PI4KAP2A4QPH2 592 aa8.81□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 SREBF2Q12772 1141 aa8.81□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 MTFR1Q15390 333 aa8.81□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.81□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa8.81□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM43AQ8N2R8 423 aa8.81□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa8.81□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 TEPSINQ96N21 525 aa8.81□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 CD209Q9NNX6 404 aa8.81□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF804BA4D1E1 1349 aa8.8□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.8□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 H7C1W4 665 aa8.8□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 HOXB7P09629 217 aa8.8□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 CHRNDQ07001 517 aa8.8□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 CFAP100Q494V2 611 aa8.8□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 ARMC9Q7Z3E5 817 aa8.8□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 RUNDC1Q96C34 613 aa8.8□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 COA1Q9GZY4 146 aa8.8□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 EFCC1Q9HA90 598 aa8.8□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 OTOFQ9HC10 1997 aa8.8□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 EYSQ5T1H1 3165 aa8.8□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 SPDYE2BA6NHP3 402 aa8.79□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 SPDYE6P0CI01 402 aa8.79□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 ITGA6P23229 1130 aa8.79□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 CACNB3P54284 484 aa8.79□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 SP3Q02447 781 aa8.79□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 GOLGA2Q08379 1002 aa8.79□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 RASA3Q14644 834 aa8.79□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 CCDC184Q52MB2 194 aa8.79□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.79□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 OPTNQ96CV9 577 aa8.79□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 VEZTQ9HBM0 779 aa8.79□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 APAF1O14727 1248 aa8.78□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 CSF1RP07333 972 aa8.78□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 SLURP2P0DP57 97 aa8.78□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 FOXO4P98177 505 aa8.78□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 DLGAP5Q15398 846 aa8.78□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 OGFOD1Q8N543 542 aa8.78□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 GCC1Q96CN9 775 aa8.78□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM39BQ9GZU3 492 aa8.78□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 PRO3102Q9H379 93 aa8.78□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 VCANP13611 3396 aa8.78□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 LAMB1P07942 1786 aa8.78□□□□□ -1
CTDSP2-208ENST00000552294 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 NF2P35240 595 aa8.77□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 LMOD3Q0VAK6 560 aa8.77□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 VGLL4Q14135 290 aa8.77□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 KSR2Q6VAB6 950 aa8.77□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.77□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 TCP10L2B9ZVM9 353 aa8.76□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 ALDH1A1P00352 501 aa8.76□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 IL1R1P14778 569 aa8.76□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 GCKRQ14397 625 aa8.76□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.76□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 ERO1AQ96HE7 468 aa8.76□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 LRCH3Q96II8 777 aa8.76□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.76□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.76□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 A0A1B0GUL6 1792 aa8.76□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa8.75□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 BTBD19C9JJ37 291 aa8.75□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 F6X3S4 739 aa8.75□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 PLIN1O60240 522 aa8.75□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 DSG3P32926 999 aa8.75□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 GYG1P46976 350 aa8.75□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 MOGSQ13724 837 aa8.75□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 CCL15Q16663 113 aa8.75□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 TRIM47Q96LD4 638 aa8.75□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 IFT57Q9NWB7 429 aa8.75□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 MYO3BQ8WXR4 1341 aa8.75□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 INHBEP58166 350 aa8.74□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa8.74□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.74□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa8.74□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms