RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546935.5

CSRNP2-202, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene CSRNP2, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2-202ENST00000546935 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.5■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 GYG1P46976 350 aa26.49■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 FSTL1Q12841 308 aa26.49■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 KBTBD3Q8NAB2 608 aa26.49■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 HMG20BQ9P0W2 317 aa26.49■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 POLLQ9UGP5 575 aa26.49■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa26.49■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 MYH7P12883 1935 aa26.48■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 HIP1O00291 1037 aa26.48■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 SEMA3EO15041 775 aa26.48■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 UFL1O94874 794 aa26.48■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 SEC24BO95487 1268 aa26.48■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 RASGRF1Q13972 1273 aa26.48■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 RRAGCQ9HB90 399 aa26.48■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 GOLIM4O00461 696 aa26.47■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 ZAP70P43403 619 aa26.47■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.47■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 MPNDQ8N594 471 aa26.47■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 SPATA5Q8NB90 893 aa26.46■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 FSD1Q9BTV5 496 aa26.46■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CSRNP2-202ENST00000546935 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 OLFM4Q6UX06 510 aa26.45■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 PI16Q6UXB8 463 aa26.45■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 VPS33BQ9H267 617 aa26.45■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.45■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 SNRKQ9NRH2 765 aa26.45■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa26.44■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 DENND2AQ9ULE3 1009 aa26.44■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.43■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 VPS37DQ86XT2 251 aa26.43■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.42■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 RAD50Q92878 1312 aa26.41■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 C6orf229H3BNL8 230 aa26.41■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 JDP2Q8WYK2 163 aa26.41■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa26.41■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 SCN4AP35499 1836 aa26.4■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.4■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 FZD9O00144 591 aa26.4■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 SGSM2O43147 1006 aa26.4■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 IL1R1P14778 569 aa26.4■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 APLP1P51693 650 aa26.4■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.4■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 RUFY2Q8WXA3 655 aa26.4■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 EYA3Q99504 573 aa26.4■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 POTECB2RU33 542 aa26.39■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 CD209Q9NNX6 404 aa26.39■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
CSRNP2-202ENST00000546935 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 IGSF3O75054 1194 aa26.38■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 IL25Q9H293 177 aa26.38■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 REC8O95072 547 aa26.37■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 COA1Q9GZY4 146 aa26.37■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 MAST2Q6P0Q8 1798 aa26.37■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 SALL1Q9NSC2 1324 aa26.37■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa26.36■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa26.36■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 GPC2Q8N158 579 aa26.36■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 FAM227BQ96M60 508 aa26.36■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 A0A0D9SFI3 127 aa26.35■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.35■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 HELLSQ9NRZ9 838 aa26.35■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.35■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 ADD2P35612 726 aa26.34■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 UBE3CQ15386 1083 aa26.34■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 WASHC4Q2M389 1173 aa26.34■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.33■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 USP26Q9BXU7 913 aa26.33■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 COL4A5P29400 1685 aa26.33■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.33■■□□□ 1.81
CSRNP2-202ENST00000546935 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CSRNP2-202ENST00000546935 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms