RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545264.1

CCDC82-208, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC82, Length 557 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-208ENST00000545264 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CCDC82-208ENST00000545264 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.55□□□□□ -1.04
CCDC82-208ENST00000545264 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.55□□□□□ -1.04
CCDC82-208ENST00000545264 WNT8BQ93098 351 aa8.55□□□□□ -1.04
CCDC82-208ENST00000545264 TCF12Q99081 682 aa8.55□□□□□ -1.04
CCDC82-208ENST00000545264 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.55□□□□□ -1.04
CCDC82-208ENST00000545264 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.55□□□□□ -1.04
CCDC82-208ENST00000545264 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.54□□□□□ -1.04
CCDC82-208ENST00000545264 METTL12A8MUP2 240 aa8.54□□□□□ -1.04
CCDC82-208ENST00000545264 MAPK8P45983 427 aa8.54□□□□□ -1.04
CCDC82-208ENST00000545264 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.54□□□□□ -1.04
CCDC82-208ENST00000545264 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.54□□□□□ -1.04
CCDC82-208ENST00000545264 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCDC82-208ENST00000545264 IKBKEQ14164 716 aa8.53□□□□□ -1.04
CCDC82-208ENST00000545264 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CCDC82-208ENST00000545264 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CCDC82-208ENST00000545264 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.53□□□□□ -1.04
CCDC82-208ENST00000545264 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.53□□□□□ -1.04
CCDC82-208ENST00000545264 A0A096LPE4 126 aa8.52□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 A0A1W2PPZ6 126 aa8.52□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 GRIA4P48058 902 aa8.52□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 ARL4DP49703 201 aa8.52□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.52□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.52□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.52□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 TM4SF5O14894 197 aa8.51□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.51□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.51□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa8.51□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa8.51□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 ATP2B2Q01814 1243 aa8.5□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.5□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 GRM2Q14416 872 aa8.5□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 PI16Q6UXB8 463 aa8.5□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 FBF1Q8TES7 1133 aa8.5□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.5□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.5□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 KCNK4Q9NYG8 393 aa8.5□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 PCDH1Q08174 1060 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 HGSNATQ68CP4 663 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 ABCB6Q9NP58 842 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 F8W735 103 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 ADAM11O75078 769 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 ITPKAP23677 461 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 NOS3P29474 1203 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 WISP1O95388 367 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 NLRP12P59046 1061 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 DOC2BQ14184 412 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 ACAD11Q709F0 780 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 SETDB2Q96T68 719 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 BCO2Q9BYV7 579 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 ZNF576Q9H609 170 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC82-208ENST00000545264 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.46□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 ALX3O95076 343 aa8.46□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 ITGB7P26010 798 aa8.46□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 COL19A1Q14993 1142 aa8.46□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 CCDC27Q2M243 656 aa8.46□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 NBPF11Q86T75 865 aa8.46□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.46□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.46□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 GSTM4Q03013 218 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 DTHD1Q6ZMT9 781 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.45□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 B3GALT4O96024 378 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 FCGRTP55899 365 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 USP26Q9BXU7 913 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms