RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GPR182O15218 404 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CCP110O43303 1012 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FIBPO43427 364 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FOXO3O43524 673 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FZD6O60353 706 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FGRP09769 529 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 JUNDP17535 347 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGFBP4P22692 258 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HOXC13P31276 330 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DDB1Q16531 1140 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DOK7Q18PE1 504 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GRAMD1BQ3KR37 738 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AMOTQ4VCS5 1084 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ANKRD45Q5TZF3 282 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARMC3Q5W041 872 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C11orf74Q86VG3 221 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 STK11IPQ8N1F8 1099 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC39A7Q92504 469 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LZTS2Q9BRK4 669 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HOMER2Q9NSB8 354 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DCAF16Q9NXF7 216 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PGAP2Q9UHJ9 254 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 USP25Q9UHP3 1055 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.42□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SKILP12757 684 aa8.41□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GNA15P30679 374 aa8.41□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 USP4Q13107 963 aa8.41□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HYIQ5T013 277 aa8.41□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.41□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.41□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZBTB33Q86T24 672 aa8.41□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 USP48Q86UV5 1035 aa8.41□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TEKT1Q969V4 418 aa8.41□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM87BQ96K49 555 aa8.41□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SERINC2Q96SA4 455 aa8.41□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.41□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IQCA1LA6NCM1 817 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TSPAN6O43657 245 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZBED6P86452 979 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RASA3Q14644 834 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TOMM20Q15388 145 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TSHZ3Q63HK5 1081 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BRICD5Q6PL45 260 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CCDC191Q8NCU4 936 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 APPL2Q8NEU8 664 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZFPM2Q8WW38 1151 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 E2F7Q96AV8 911 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CRELD1Q96HD1 420 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KNSTRNQ9Y448 316 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM170AA1A519 330 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRSS47A8MTI9 375 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ESPNB1AK53 854 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CTSHP09668 335 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SRGNP10124 158 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MAGEA8P43361 318 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PARP10Q53GL7 1025 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPECC1Q5M775 1068 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 JMYQ8N9B5 988 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TAF4BQ92750 862 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TBC1D20Q96BZ9 403 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.38□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM25EA8MYX2 175 aa8.38□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RIMBP2O15034 1052 aa8.38□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MSL3P1P0C860 447 aa8.38□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MORC3Q14149 939 aa8.38□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C16orf46Q6P387 395 aa8.38□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms