RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZUG5 572 aa9.19□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.19□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 SYT1P21579 422 aa9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 LMO7Q8WWI1 1683 aa9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 ALS2Q96Q42 1657 aa9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 MBD3O95983 291 aa9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 TDO2P48775 406 aa9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 PARP10Q53GL7 1025 aa9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 HS1BP3Q53T59 392 aa9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 AK7Q96M32 723 aa9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC37A3O60309 1634 aa9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 SYCE3A1L190 88 aa9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 CASP7P55210 303 aa9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 GUCY1B3Q02153 619 aa9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 NECTIN1Q15223 517 aa9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 ME3Q16798 604 aa9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 TTLL5Q6EMB2 1281 aa9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 CIAO1O76071 339 aa9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 PDE8BO95263 885 aa9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 PHKA1P46020 1223 aa9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 KLHL40Q2TBA0 621 aa9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 CAVIN4Q5BKX8 364 aa9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 BICD2Q8TD16 824 aa9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 NLRP3Q96P20 1036 aa9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 NAPBQ9H115 298 aa9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 ERVV-1B6SEH8 477 aa9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 LARGE1O95461 756 aa9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 RPS6KB1P23443 525 aa9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 NASPP49321 788 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 ITPK1Q13572 414 aa9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 OTUD6BQ8N6M0 293 aa9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 PPP1R9BQ96SB3 815 aa9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 AK9Q5TCS8 1911 aa9.17□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 CYP21A2P08686 494 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC102BQ68D86 513 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 GPR108Q9NPR9 543 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 HELLSQ9NRZ9 838 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 TPCN1Q9ULQ1 816 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 CNPY2Q9Y2B0 182 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 MINDY4BA8MYZ0 360 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 GPAA1O43292 621 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 KRT85P78386 507 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 APOBRQ0VD83 1088 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 SCARF1Q14162 830 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 FAM173BQ6P4H8 233 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 MAGEB6Q8N7X4 407 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 MIGA1Q8NAN2 632 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 LPIN2Q92539 896 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 TM6SF1Q9BZW5 370 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 JAG2Q9Y219 1238 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 EIF5P55010 431 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 APPBP2Q92624 585 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 NACAP1Q9BZK3 213 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 TAF6LQ9Y6J9 622 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 CUL4AQ13619 759 aa9.15□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.15□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 OSBP2Q969R2 916 aa9.15□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 BCL9O00512 1426 aa9.15□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 KDM3BQ7LBC6 1761 aa9.15□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 ERICH2A1L162 156 aa9.15□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 FBXW7Q969H0 707 aa9.15□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 MAST3O60307 1309 aa9.15□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 G3V3G9 751 aa9.15□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 BRD1O95696 1058 aa9.15□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 BCAMP50895 628 aa9.15□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.15□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 USP48Q86UV5 1035 aa9.15□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.15□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.15□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA8BA8MQT2 603 aa9.14□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 F13A1P00488 732 aa9.14□□□□□ -0.95
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