RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 CNPY2Q9Y2B0 182 aa27.07■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 TCHHQ07283 1943 aa27.07■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 IDH1O75874 414 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 FGD1P98174 961 aa27.07■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 LY75O60449 1722 aa27.06■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 PFKFB2O60825 505 aa27.06■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 PDE6AP16499 860 aa27.06■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 RASGRF1Q13972 1273 aa27.06■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 A0A1B0GUL6 1792 aa27.06■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 CHRNDQ07001 517 aa27.05■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 FBXL16Q8N461 479 aa27.05■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF532Q9HCE3 1301 aa27.05■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa27.05■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 SNAP23O00161 211 aa27.05■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.05■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 SLC10A5Q5PT55 438 aa27.04■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.04■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 C3orf67Q6ZVT6 689 aa27.04■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 SCRN1Q12765 414 aa27.03■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 CDC37L1Q7L3B6 337 aa27.03■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.03■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 SBF2Q86WG5 1849 aa27.03■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 GNPATO15228 680 aa27.02■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 APOBRQ0VD83 1088 aa27.02■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa27.02■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa27.02■■□□□ 1.92
PDE4D-223ENST00000515011 JAK2O60674 1132 aa27.01■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 HAND2P61296 217 aa27.01■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa27.01■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 FAM182BQ5T319 152 aa27.01■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 SMIM5Q71RC9 77 aa27.01■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 NYXQ9GZU5 481 aa27.01■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.01■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF213O14771 459 aa27■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 MAP3K12Q12852 859 aa27■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 BCAMP50895 628 aa26.99■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 EVCP57679 992 aa26.99■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 AFF2P51816 1311 aa26.99■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 UBE2HP62256 183 aa26.99■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 FIBPO43427 364 aa26.98■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 ZPR1O75312 459 aa26.98■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 WDR19Q8NEZ3 1342 aa26.98■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 NCOA7Q8NI08 942 aa26.98■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 SETDB2Q96T68 719 aa26.98■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.97■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 ZMYM6O95789 1325 aa26.97■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 C4BP0C0L5 1744 aa26.97■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 MCM5P33992 734 aa26.97■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 LRSAM1Q6UWE0 723 aa26.97■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 CHST3Q7LGC8 479 aa26.97■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 MAGEB6Q8N7X4 407 aa26.97■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 AIDAQ96BJ3 306 aa26.97■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 CHMP4CQ96CF2 233 aa26.97■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 C4AP0C0L4 1744 aa26.96■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 UBE4AQ14139 1066 aa26.96■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 ALX1Q15699 326 aa26.96■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 NBPF3Q9H094 633 aa26.96■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 PRC1O43663 620 aa26.95■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 CTDNEP1O95476 244 aa26.95■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
PDE4D-223ENST00000515011 TAF1P21675 1872 aa26.95■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 SYCE3A1L190 88 aa26.95■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 FERMT3Q86UX7 667 aa26.95■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 ANTXR2P58335 489 aa26.94■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 KRT85P78386 507 aa26.94■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 SALL1Q9NSC2 1324 aa26.94■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.94■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.94■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 PTPDC1A2A3K4 754 aa26.93■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 NASPP49321 788 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 FAM184AQ8NB25 1140 aa26.93■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 DDX11Q96FC9 970 aa26.93■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 APPP05067 770 aa26.92■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 CCT2P78371 535 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 TBC1D10CQ8IV04 446 aa26.92■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 NLRP3Q96P20 1036 aa26.92■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 KIF3AQ9Y496 699 aa26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms