RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513573.1

CDH18-AS1-201, CDH18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH18-AS1, Length 424 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DLGAP5Q15398 846 aa25.85■■□□□ 1.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TSPYL6Q8N831 410 aa25.85■■□□□ 1.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PTPN18Q99952 460 aa25.85■■□□□ 1.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.85■■□□□ 1.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 APAF1O14727 1248 aa25.83■■□□□ 1.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ITGA6P23229 1130 aa25.83■■□□□ 1.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.83■■□□□ 1.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CRHR2Q13324 411 aa25.83■■□□□ 1.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa25.83■■□□□ 1.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.82■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPDYE6P0CI01 402 aa25.82■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EN2P19622 333 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.82■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.82■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.82■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IL1R1P14778 569 aa25.81■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CHRNDQ07001 517 aa25.81■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.81■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EFCC1Q9HA90 598 aa25.81■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SP3Q02447 781 aa25.8■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GCKRQ14397 625 aa25.8■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.79■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.79■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.79■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AOX1Q06278 1338 aa25.79■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SZT2Q5T011 3432 aa25.78■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CFAP100Q494V2 611 aa25.78■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF333Q96JL9 665 aa25.78■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SNAP23O00161 211 aa25.77■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 G2E3Q7L622 706 aa25.77■■□□□ 1.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MYO1BO43795 1136 aa25.76■■□□□ 1.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CLRN2A0PK11 232 aa25.75■■□□□ 1.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RASA3Q14644 834 aa25.75■■□□□ 1.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 A0A1B0GUL6 1792 aa25.74■■□□□ 1.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TAF5LO75529 589 aa25.73■■□□□ 1.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KCNJ4P48050 445 aa25.73■■□□□ 1.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TEPSINQ96N21 525 aa25.73■■□□□ 1.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 STK31Q9BXU1 1019 aa25.73■■□□□ 1.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC4A2P04920 1241 aa25.72■■□□□ 1.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OTOFQ9HC10 1997 aa25.72■■□□□ 1.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.71■■□□□ 1.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.71■■□□□ 1.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LINS1Q8NG48 757 aa25.71■■□□□ 1.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.71■■□□□ 1.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OPTNQ96CV9 577 aa25.71■■□□□ 1.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TMEM106CQ9BVX2 250 aa25.71■■□□□ 1.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 F8W031 263 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FOXO4P98177 505 aa25.7■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.7■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.7■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 VEZTQ9HBM0 779 aa25.7■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NBPF11Q86T75 865 aa25.69■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.69■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FLIIQ13045 1269 aa25.68■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TNFAIP1Q13829 316 aa25.68■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ARHGEF6Q15052 776 aa25.68■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OTUD5Q96G74 571 aa25.68■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ELP3Q9H9T3 547 aa25.68■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.68■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa25.68■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CEP290O15078 2479 aa25.68■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.67■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCDC27Q2M243 656 aa25.66■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa25.66■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.66■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa25.66■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GTF2A2P52657 109 aa25.65■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.65■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.65■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MAP3K9P80192 1104 aa25.64■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 VGLL4Q14135 290 aa25.64■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.63■■□□□ 1.69
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCL15Q16663 113 aa25.63■■□□□ 1.69
CDH18-AS1-201ENST00000513573 JAG2Q9Y219 1238 aa25.63■■□□□ 1.69
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa25.62■■□□□ 1.69
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TLR2O60603 784 aa25.62■■□□□ 1.69
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms