RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF394Q53GI3 561 aa3.15□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 USPL1Q5W0Q7 1092 aa3.15□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 MCTP1Q6DN14 999 aa3.15□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 NT5C1AQ9BXI3 368 aa3.15□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC113Q9H0I3 377 aa3.15□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 SUV39H2Q9H5I1 410 aa3.15□□□□□ -1.9
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PDE4D-218ENST00000509368 TRPA1O75762 1119 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 ACPPP15309 386 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 TATP17735 454 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 TCEAL1Q15170 157 aa3.15□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 WDR44Q5JSH3 913 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 KIAA0319Q5VV43 1072 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 PI16Q6UXB8 463 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF662Q6ZS27 426 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 SV2BQ7L1I2 683 aa3.15□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 KIAA0825Q8IV33 1275 aa3.15□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 SYNPOQ8N3V7 929 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 OR6P1Q8NGX9 317 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 KLF15Q9UIH9 416 aa3.15□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 MARCH6O60337 910 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 ARSDP51689 593 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 TNP2Q05952 138 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 C8orf34Q49A92 452 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM22Q8IYM9 498 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 DNAJC6O75061 913 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 TNFRSF21O75509 655 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 SASH3O75995 380 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 EGFRP00533 1210 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 EPB42P16452 691 aa3.14□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 JAZF1Q86VZ6 243 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 SPC25Q9HBM1 224 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 USP17L7P0C7H9 530 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 HHIPQ96QV1 700 aa3.14□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 SEMA6BQ9H3T3 888 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 CNTN3Q9P232 1028 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 KANSL3Q9P2N6 904 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 PLEKHD1A6NEE1 506 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 KLF4O43474 513 aa3.13□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 RAB33AQ14088 237 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 PGBD3Q8N328 593 aa3.13□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 RELTQ969Z4 430 aa3.13□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 EFCC1Q9HA90 598 aa3.13□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 RAB11FIP3O75154 756 aa3.13□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 NCAPD3P42695 1498 aa3.12□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 RPS26P62854 115 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 LYPD4Q6UWN0 246 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 HFE2Q6ZVN8 426 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF438Q7Z4V0 828 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 C1orf127Q8N9H9 656 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 BHMTQ93088 406 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM55Q9BYV6 548 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 GSX2Q9BZM3 304 aa3.12□□□□□ -1.91
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