RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP2-209ENST00000504450 GJB2P29033 226 aa12.82□□□□□ -0.36
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SH3BP2-209ENST00000504450 SPATA5Q8NB90 893 aa12.82□□□□□ -0.36
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SH3BP2-209ENST00000504450 ADRA2BP18089 450 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS8P62241 208 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-209ENST00000504450 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAPPC3LQ5T215 181 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-209ENST00000504450 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-209ENST00000504450 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-209ENST00000504450 NLRP3Q96P20 1036 aa12.78□□□□□ -0.36
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SH3BP2-209ENST00000504450 IDH1O75874 414 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
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