RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 COL4A1P02462 1669 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC102BQ68D86 513 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 APPBP2Q92624 585 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 FSD2A1L4K1 749 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 SLC5A1P13866 664 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 PHKA1P46020 1223 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 NARFQ9UHQ1 456 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 ZPR1O75312 459 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 SYT1P21579 422 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 GJB2P29033 226 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 STOX1Q6ZVD7 989 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 BCL2L12Q9HB09 334 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 CHD4Q14839 1912 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 STX6O43752 255 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 ADD2P35612 726 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 WASHC4Q2M389 1173 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 ERFEQ4G0M1 354 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 FOXP2O15409 715 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 SLC10A5Q5PT55 438 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 MYH13Q9UKX3 1938 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 UBE3CQ15386 1083 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 TBC1D9BQ66K14 1250 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 Q6ZUG5 572 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 NECAB1Q8N987 351 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 CTNNA3Q9UI47 895 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 E7EWF7 191 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 CHRNDQ07001 517 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 CHAMP1Q96JM3 812 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 AGXT2Q9BYV1 514 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 NYXQ9GZU5 481 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 RNF39Q9H2S5 420 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 GPAA1O43292 621 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 ZBTB7AO95365 584 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 F13A1P00488 732 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA5Q8NB90 893 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0G2JLW4 131 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 SNAP23O00161 211 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 RASGRF1Q13972 1273 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 MSL1Q68DK7 614 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 GPT2Q8TD30 523 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 GTF3C6Q969F1 213 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.71□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa9.71□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 DCAF8L1A6NGE4 600 aa9.71□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 IDH1O75874 414 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 FGAP02671 866 aa9.71□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 GYS1P13807 737 aa9.71□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 PDE6AP16499 860 aa9.71□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 TTLL5Q6EMB2 1281 aa9.71□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.71□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 FBXL16Q8N461 479 aa9.71□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 SETDB2Q96T68 719 aa9.71□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
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PDE4D-208ENST00000502484 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa9.71□□□□□ -0.85
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PDE4D-208ENST00000502484 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 MBD3O95983 291 aa9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 BRF1Q92994 677 aa9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF804BA4D1E1 1349 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 PDCP20941 246 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 MRE11P49959 708 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 STK3Q13188 491 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 UBE4AQ14139 1066 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 NLGN1Q8N2Q7 840 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC2Q9BYS8 371 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-208ENST00000502484 MTFR1LQ9H019 292 aa9.7□□□□□ -0.86
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