RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496641.1

MRPS33-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S33, human

TSL 2

Gene MRPS33, Length 541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS33-208	ENST00000496641	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MRPS33-208	ENST00000496641	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
MRPS33-208	ENST00000496641	MORC1	Q86VD1	984 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MRPS33-208	ENST00000496641	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MRPS33-208	ENST00000496641	OGFOD1	Q8N543	542 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MRPS33-208	ENST00000496641	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
MRPS33-208	ENST00000496641	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MRPS33-208	ENST00000496641	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		13.96	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	UFL1	O94874	794 aa		13.95	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	MYL6B	P14649	208 aa		13.95	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	CAPN2	P17655	700 aa		13.95	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	HOXD10	P28358	340 aa		13.95	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.95	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	GTF2A2	P52657	109 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	PRKCZ	Q05513	592 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	DACT2	Q5SW24	774 aa		13.93	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		13.93	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.93	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	ELN	P15502	786 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	NLRP10	Q86W26	655 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	GABRQ	Q9UN88	632 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	MYO9B	Q13459	2157 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	ADCY3	O60266	1144 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	INHA	P05111	366 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	MRE11	P49959	708 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	PODN	Q7Z5L7	613 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	ASB2	Q96Q27	587 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	NBPF3	Q9H094	633 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	GGA1	Q9UJY5	639 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MRPS33-208	ENST00000496641	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		13.9	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	MCM10	Q7L590	875 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	CACNA1G	O43497	2377 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	CETP	P11597	493 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	VGLL4	Q14135	290 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	FBXW7	Q969H0	707 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	PFAS	O15067	1338 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	REV3L	O60673	3130 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	FLT3LG	P49771	235 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	MMP14	P50281	582 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	13.85	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	PANK3	Q9H999	370 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	AOX1	Q06278	1338 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	DCTN1	Q14203	1278 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MRPS33-208	ENST00000496641	FCGRT	P55899	365 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MRPS33-208	ENST00000496641	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
MRPS33-208	ENST00000496641	RASA3	Q14644	834 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MRPS33-208	ENST00000496641	GRIN2C	Q14957	1233 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MRPS33-208	ENST00000496641	DLGAP5	Q15398	846 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MRPS33-208	ENST00000496641	SHH	Q15465	462 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MRPS33-208	ENST00000496641	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		13.83	□□□□□ -0.2

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