RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 TCHHQ07283 1943 aa23.72■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 FGAP02671 866 aa23.72■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.72■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 NECAB1Q8N987 351 aa23.72■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 NLRP3Q96P20 1036 aa23.72■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.72■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.72■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.71■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 STX6O43752 255 aa23.71■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 GJB2P29033 226 aa23.71■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 BCAMP50895 628 aa23.71■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.71■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 Q6ZUG5 572 aa23.71■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 FSD2A1L4K1 749 aa23.7■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 IDH1O75874 414 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 RFC4P35249 363 aa23.7■■□□□ 1.39
NELFE-211ENST00000492185 ZBTB22O15209 634 aa23.7■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 TM4SF1P30408 202 aa23.7■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.7■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 ZMYM6O95789 1325 aa23.69■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 ALX1Q15699 326 aa23.69■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 GTF3C6Q969F1 213 aa23.69■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 MAP3K12Q12852 859 aa23.68■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 NFIXQ14938 502 aa23.68■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 MTMR6Q9Y217 621 aa23.68■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 CHAMP1Q96JM3 812 aa23.67■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 PFKFB2O60825 505 aa23.66■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 EVCP57679 992 aa23.66■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 WDR19Q8NEZ3 1342 aa23.66■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.66■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 F13A1P00488 732 aa23.65■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.65■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 BRF1Q92994 677 aa23.65■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 PHF14O94880 888 aa23.65■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.65■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.65■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 NBPF3Q9H094 633 aa23.65■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 CACNA1SQ13698 1873 aa23.65■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 CHD4Q14839 1912 aa23.65■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.64■■□□□ 1.38
NELFE-211ENST00000492185 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 PDCP20941 246 aa23.64■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 MAGEB6Q8N7X4 407 aa23.64■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.63■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.63■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 SEMA3EO15041 775 aa23.63■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 GYG1P46976 350 aa23.63■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.63■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 GYS1P13807 737 aa23.62■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.62■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 GPT2Q8TD30 523 aa23.62■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 AIDAQ96BJ3 306 aa23.62■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 ZNF213O14771 459 aa23.61■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 TRIM37O94972 964 aa23.61■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 HAND2P61296 217 aa23.61■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.61■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 SCRN1Q12765 414 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 CNBD1Q8NA66 436 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 MBD4O95243 580 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 STK3Q13188 491 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 NCOA7Q8NI08 942 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 MBD3O95983 291 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 MCM5P33992 734 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 ANTXR2P58335 489 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 APOBRQ0VD83 1088 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 PROM2Q8N271 834 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.58■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 GNAT2P19087 354 aa23.58■■□□□ 1.37
NELFE-211ENST00000492185 FGD1P98174 961 aa23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms