RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-208ENST00000490302 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.17■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 F8W031 263 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 MYO1BO43795 1136 aa22.15■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.15■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.15■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 CFAP100Q494V2 611 aa22.14■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 CCDC184Q52MB2 194 aa22.14■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 IFNL1Q8IU54 200 aa22.14■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 WNK4Q96J92 1243 aa22.14■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.14■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 CLRN2A0PK11 232 aa22.14■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 IL1R1P14778 569 aa22.14■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 FOXO4P98177 505 aa22.14■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.14■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.13■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.13■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 VEZTQ9HBM0 779 aa22.13■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 UNCXA6NJT0 531 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 SPDYE6P0CI01 402 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 TRIM17Q9Y577 477 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 VAMP4O75379 141 aa22.11■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.1■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 JAG2Q9Y219 1238 aa22.1■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.09■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 F6X3S4 739 aa22.09■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 PLIN1O60240 522 aa22.09■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.09■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.09■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 BEND3Q5T5X7 828 aa22.09■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 RASA3Q14644 834 aa22.08■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.08■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.08■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.08■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.08■■□□□ 1.13
PKDCC-208ENST00000490302 AOX1Q06278 1338 aa22.08■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.07■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 ERO1AQ96HE7 468 aa22.07■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.06■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.06■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 GJA5P36382 358 aa22.06■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 WDR63Q8IWG1 891 aa22.06■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 A0A1B0GUL6 1792 aa22.05■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.05■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 GRM8O00222 908 aa22.05■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 CRHR2Q13324 411 aa22.05■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 TNFAIP1Q13829 316 aa22.05■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.05■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 UBE4AQ14139 1066 aa22.03■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 ELP3Q9H9T3 547 aa22.03■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.03■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 POTEFA5A3E0 1075 aa22.02■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 GCC1Q96CN9 775 aa22.02■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 OPTNQ96CV9 577 aa22.02■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 PTPN18Q99952 460 aa22.02■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 EFCC1Q9HA90 598 aa22.02■■□□□ 1.12
PKDCC-208ENST00000490302 CACNA1FO60840 1977 aa22.01■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 LAMB1P07942 1786 aa22.01■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 GYG1P46976 350 aa22.01■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 SP3Q02447 781 aa22.01■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 MRS2Q9HD23 443 aa22.01■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 ALDH1L1O75891 902 aa21.99■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.98■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 CRKP46108 304 aa21.98■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 TNNI2P48788 182 aa21.98■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.98■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.98■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 TEPSINQ96N21 525 aa21.98■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.98■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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